More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2648 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2648  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
340 aa  697    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131768  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  34.64 
 
 
308 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1359  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  37.5 
 
 
313 aa  171  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0929144  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.93 
 
 
333 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  34.52 
 
 
331 aa  169  7e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.93 
 
 
332 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.63 
 
 
332 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0607  alcohol dehydrogenase  35.84 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.1 
 
 
314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.22 
 
 
320 aa  166  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.1 
 
 
332 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.33 
 
 
332 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  31.1 
 
 
332 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.63 
 
 
332 aa  165  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.9 
 
 
333 aa  165  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0663  alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 
327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951167  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.5 
 
 
332 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.09 
 
 
332 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.33 
 
 
317 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
317 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1291  alcohol dehydrogenase  35.57 
 
 
333 aa  161  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0304  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.49 
 
 
333 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337818  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2770  oxidoreductase, zinc-binding  32.93 
 
 
308 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000066091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.74 
 
 
317 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  32.44 
 
 
317 aa  159  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0637  alcohol dehydrogenase  35.5 
 
 
327 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6616  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.16 
 
 
333 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809993  normal  0.12586 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6082  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.4 
 
 
333 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.25 
 
 
332 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.12 
 
 
333 aa  156  6e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0112  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.65 
 
 
334 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.985575  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.79 
 
 
639 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2563  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.53 
 
 
311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111047  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  33.98 
 
 
313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.12 
 
 
332 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.561788  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  34.29 
 
 
312 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3717  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.14 
 
 
322 aa  150  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137861  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0948  NADPH:quinone reductase related Zn-dependent oxidoreductase  38.93 
 
 
312 aa  149  6e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.102607  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4384  alcohol dehydrogenase  34.02 
 
 
333 aa  149  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3540  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.29 
 
 
333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971542  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4584  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.06 
 
 
333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.978307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3507  alcohol dehydrogenase  35.19 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2051  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.92 
 
 
333 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.411515  hitchhiker  0.000175351 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2124  alcohol dehydrogenase  32.08 
 
 
335 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185459  normal  0.116252 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0506  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.03 
 
 
317 aa  146  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.13 
 
 
314 aa  146  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  34.12 
 
 
304 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3883  alcohol dehydrogenase  34.08 
 
 
326 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.014306  normal  0.116687 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  31.62 
 
 
333 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0714  alcohol dehydrogenase  34.02 
 
 
334 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4764  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  33.92 
 
 
324 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000104281  hitchhiker  0.000232398 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3545  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.53 
 
 
339 aa  143  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3647  alcohol dehydrogenase  32.15 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.38 
 
 
336 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  0.659937 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1862  oxidoreductase, zinc-binding protein  29.5 
 
 
333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0417  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.23 
 
 
323 aa  139  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1997  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.16 
 
 
341 aa  139  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  35.18 
 
 
305 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3538  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.92 
 
 
327 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242402  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  30.32 
 
 
307 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.051943  normal  0.176939 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2281  alcohol dehydrogenase  32.92 
 
 
339 aa  138  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.166638 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3524  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.62 
 
 
323 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166573  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4198  alcohol dehydrogenase  33.92 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00226105  normal  0.135586 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  30.68 
 
 
339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1050  alcohol dehydrogenase  32.34 
 
 
320 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.889388  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.04 
 
 
338 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2704  alcohol dehydrogenase  31.16 
 
 
337 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3681  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.86 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442744  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2019  alcohol dehydrogenase  32.6 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  31.19 
 
 
308 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37060  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  31.61 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.67 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  31.55 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.18 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  33.01 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  32.18 
 
 
331 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2062  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.45 
 
 
334 aa  134  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0178  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.54 
 
 
302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0108316  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1494  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  35.67 
 
 
338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253421  normal  0.032291 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0176  alcohol dehydrogenase  34.54 
 
 
302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0261853  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0197  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.31 
 
 
302 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0165  alcohol dehydrogenase, zinc containing  34.54 
 
 
302 aa  133  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0697  alcohol dehydrogenase  35.25 
 
 
329 aa  133  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4859  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.32 
 
 
313 aa  133  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000939315  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3490  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.73 
 
 
287 aa  133  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0444759  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01926  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.74 
 
 
335 aa  133  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3963  NADPH:quinone reductase  30.68 
 
 
317 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5428  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.25 
 
 
330 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1067  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.22 
 
 
309 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1829  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.94 
 
 
312 aa  132  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000146701  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0168  alcohol dehydrogenase, zinc containing  34.14 
 
 
302 aa  132  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.662209  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.29 
 
 
331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.04 
 
 
310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1504  alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 
333 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.139822  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1237  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.3 
 
 
308 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  32.26 
 
 
314 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1959  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.29 
 
 
333 aa  130  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5268  alcohol dehydrogenase  29.94 
 
 
333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1716  alcohol dehydrogenase  34.95 
 
 
339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.616978  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0221  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.98 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000569438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>