49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1756 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1756  cyclase family protein  100 
 
 
191 aa  397  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0509  cyclase family protein  40.93 
 
 
192 aa  148  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.876245  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3839  cyclase family protein  36.98 
 
 
183 aa  122  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.302477  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0598  cyclase family protein  34.15 
 
 
196 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0920009  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  31.61 
 
 
213 aa  62  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  31.34 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  28.34 
 
 
221 aa  58.2  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  32.21 
 
 
222 aa  57.8  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  28.9 
 
 
217 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  29.85 
 
 
205 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0414  cyclase family protein  33.91 
 
 
267 aa  56.6  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  29.05 
 
 
236 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  29.33 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  31.08 
 
 
215 aa  53.1  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  27.33 
 
 
256 aa  51.6  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  28.88 
 
 
377 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  27.27 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2580  putative cyclase  30.28 
 
 
219 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.450576 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16260  cyclase family protein  27.27 
 
 
192 aa  49.3  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  30.43 
 
 
213 aa  48.5  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  27.82 
 
 
254 aa  48.5  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  30.07 
 
 
212 aa  48.5  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1500  cyclase family protein  34.88 
 
 
238 aa  48.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.256572  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  26.95 
 
 
257 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  26.16 
 
 
216 aa  47.4  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  30.56 
 
 
209 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  26.45 
 
 
253 aa  45.4  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  29.17 
 
 
209 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  28.47 
 
 
209 aa  44.7  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  29.17 
 
 
209 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  29.17 
 
 
209 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  26.97 
 
 
216 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  25.42 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  24.02 
 
 
249 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  25.73 
 
 
280 aa  43.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  21.39 
 
 
233 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  22.82 
 
 
214 aa  43.1  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  21.81 
 
 
233 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  23.02 
 
 
216 aa  42.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  23.49 
 
 
217 aa  42.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  29 
 
 
228 aa  42.4  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1418  hypothetical protein  31.65 
 
 
222 aa  42.4  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.822292  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  28.47 
 
 
209 aa  42  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  28.1 
 
 
287 aa  42  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  28.47 
 
 
209 aa  42  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  22.86 
 
 
219 aa  42  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  28.47 
 
 
209 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  24.62 
 
 
214 aa  41.6  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  29.52 
 
 
211 aa  41.2  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>