30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1361 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1361  50S ribosomal protein L44e  100 
 
 		 94 aa  182  1.0000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.170181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1685  50S ribosomal protein L44e  64.84 
 
 		 91 aa  127  6e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.826893  normal  0.690039 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0435  50S ribosomal protein L44e  67.03 
 
 		 91 aa  127  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2021  Ribosomal protein L44E  61.29 
 
 		 95 aa  120  5e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.157519  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0644  50S ribosomal protein L44e  67.39 
 
 		 95 aa  120  6e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000000450289  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1785  50S ribosomal protein L44e  61.54 
 
 		 91 aa  119  9e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0270712 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0993  50S ribosomal protein L44e  65.85 
 
 		 83 aa  114  5e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1804  50S ribosomal protein L44e  53.76 
 
 		 95 aa  110  9e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1579  50S ribosomal protein L44e  44.09 
 
 		 93 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28038  Ribosomal protein L36a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  37.78 
 
 		 103 aa  66.6  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.265485 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_8185  predicted protein  36.56 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.484224  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1154  Ribosomal protein L44E  36.17 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06181  60S ribosomal protein L44 P (Broad)  40.22 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1011  50S ribosomal protein L44e  37.23 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81825  60S ribosomal protein L44  40.22 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0270897  normal  0.128685 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0962  50S ribosomal protein L44e  37.23 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.243844  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0984  50S ribosomal protein L44e  36.17 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2878  Ribosomal protein L44E  34.04 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.362211 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1394  50S ribosomal protein L44e  38.71 
 
 		 92 aa  53.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00510964  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0701  50S ribosomal protein L44e  36.56 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.819978  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0872  Ribosomal protein L44E  36.56 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2500  Ribosomal protein L44E  34.41 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1697  50S ribosomal protein L44e  37.5 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0418  50S ribosomal protein L44e  33.7 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.258932  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2788  50S ribosomal protein L44e  31.18 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0268055  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1301  50S ribosomal protein L44e  34.78 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0955  50S ribosomal protein L44e  31.52 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.836007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1011  50S ribosomal protein L44e  31.18 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1130  50S ribosomal protein L44e  33.7 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.888334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1569  50S ribosomal protein L44e  32.26 
 
 		 92 aa  41.2  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>