25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1785 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1785  50S ribosomal protein L44e  100 
 
 		 91 aa  186  1e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0270712 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1685  50S ribosomal protein L44e  92.31 
 
 		 91 aa  174  4e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.826893  normal  0.690039 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0435  50S ribosomal protein L44e  89.01 
 
 		 91 aa  168  3e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0993  50S ribosomal protein L44e  89.16 
 
 		 83 aa  154  3e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2021  Ribosomal protein L44E  67.03 
 
 		 95 aa  120  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.157519  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1361  50S ribosomal protein L44e  61.54 
 
 		 94 aa  119  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.170181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1804  50S ribosomal protein L44e  63.74 
 
 		 95 aa  114  5e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0644  50S ribosomal protein L44e  58.24 
 
 		 95 aa  102  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000000450289  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1579  50S ribosomal protein L44e  46.15 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1154  Ribosomal protein L44E  39.56 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_8185  predicted protein  39.77 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.484224  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28038  Ribosomal protein L36a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  36.78 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.265485 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06181  60S ribosomal protein L44 P (Broad)  43.82 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0984  50S ribosomal protein L44e  41.33 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0962  50S ribosomal protein L44e  41.33 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.243844  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2878  Ribosomal protein L44E  31.96 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.362211 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1011  50S ribosomal protein L44e  38.67 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0701  50S ribosomal protein L44e  37.5 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.819978  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81825  60S ribosomal protein L44  42.7 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0270897  normal  0.128685 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0872  Ribosomal protein L44E  31.25 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1697  50S ribosomal protein L44e  40.58 
 
 		 87 aa  50.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2500  Ribosomal protein L44E  30.21 
 
 		 93 aa  50.8  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2788  50S ribosomal protein L44e  29.17 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0268055  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0418  50S ribosomal protein L44e  34.02 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.258932  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1011  50S ribosomal protein L44e  29.63 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>