32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1804 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1804  50S ribosomal protein L44e  100 
 
 		 95 aa  192  9e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2021  Ribosomal protein L44E  76.84 
 
 		 95 aa  152  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.157519  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0644  50S ribosomal protein L44e  64.21 
 
 		 95 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000000450289  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1785  50S ribosomal protein L44e  63.74 
 
 		 91 aa  114  5e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0270712 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1685  50S ribosomal protein L44e  62.64 
 
 		 91 aa  111  3e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.826893  normal  0.690039 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1361  50S ribosomal protein L44e  53.76 
 
 		 94 aa  110  9e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.170181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0435  50S ribosomal protein L44e  61.54 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0993  50S ribosomal protein L44e  64.63 
 
 		 83 aa  103  7e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1579  50S ribosomal protein L44e  49.45 
 
 		 93 aa  90.5  8e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1154  Ribosomal protein L44E  43.01 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_8185  predicted protein  41.94 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.484224  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0962  50S ribosomal protein L44e  42.55 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.243844  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0984  50S ribosomal protein L44e  41.49 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1011  50S ribosomal protein L44e  41.49 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1697  50S ribosomal protein L44e  43.53 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0701  50S ribosomal protein L44e  40.86 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.819978  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28038  Ribosomal protein L36a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  38.89 
 
 		 103 aa  62  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.265485 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0418  50S ribosomal protein L44e  35.71 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.258932  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06181  60S ribosomal protein L44 P (Broad)  43.01 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2878  Ribosomal protein L44E  29.29 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.362211 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2500  Ribosomal protein L44E  29.59 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0872  Ribosomal protein L44E  29.59 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2788  50S ribosomal protein L44e  27.66 
 
 		 93 aa  50.4  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0268055  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1394  50S ribosomal protein L44e  34.69 
 
 		 92 aa  50.1  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00510964  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81825  60S ribosomal protein L44  42.11 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0270897  normal  0.128685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0955  50S ribosomal protein L44e  36.56 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.836007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1301  50S ribosomal protein L44e  34.41 
 
 		 92 aa  47.8  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1569  50S ribosomal protein L44e  33.67 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1011  50S ribosomal protein L44e  28.72 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1953  50S ribosomal protein L44e  33.33 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.676794 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1130  50S ribosomal protein L44e  32.26 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.888334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2049  50S ribosomal protein L44e  34.41 
 
 		 92 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>