32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1154 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1154  Ribosomal protein L44E  100 
 
 		 94 aa  190  5e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1011  50S ribosomal protein L44e  62.77 
 
 		 93 aa  118  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0962  50S ribosomal protein L44e  62.77 
 
 		 93 aa  118  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.243844  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0984  50S ribosomal protein L44e  61.7 
 
 		 93 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1697  50S ribosomal protein L44e  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0701  50S ribosomal protein L44e  58.06 
 
 		 94 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.819978  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0418  50S ribosomal protein L44e  45.74 
 
 		 93 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.258932  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1394  50S ribosomal protein L44e  44.57 
 
 		 92 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00510964  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1953  50S ribosomal protein L44e  48.94 
 
 		 92 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.676794 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2500  Ribosomal protein L44E  43.01 
 
 		 93 aa  79  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1301  50S ribosomal protein L44e  47.42 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1569  50S ribosomal protein L44e  45.74 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1130  50S ribosomal protein L44e  47.87 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.888334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0955  50S ribosomal protein L44e  44.68 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.836007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1804  50S ribosomal protein L44e  43.01 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0872  Ribosomal protein L44E  40.86 
 
 		 93 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28038  Ribosomal protein L36a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  38.89 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.265485 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2878  Ribosomal protein L44E  37.23 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.362211 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2021  Ribosomal protein L44E  41.94 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.157519  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2049  50S ribosomal protein L44e  47.87 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1785  50S ribosomal protein L44e  39.56 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0270712 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1011  50S ribosomal protein L44e  37.89 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2788  50S ribosomal protein L44e  36.56 
 
 		 93 aa  67  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0268055  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1685  50S ribosomal protein L44e  38.46 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.826893  normal  0.690039 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1361  50S ribosomal protein L44e  36.17 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.170181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0435  50S ribosomal protein L44e  38.46 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0644  50S ribosomal protein L44e  39.13 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000000450289  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_8185  predicted protein  35.48 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.484224  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0993  50S ribosomal protein L44e  38.55 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06181  60S ribosomal protein L44 P (Broad)  39.13 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81825  60S ribosomal protein L44  36.96 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0270897  normal  0.128685 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1579  50S ribosomal protein L44e  35.16 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>