29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2878 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2878  Ribosomal protein L44E  100 
 
 		 94 aa  198  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.362211 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2788  50S ribosomal protein L44e  79.79 
 
 		 93 aa  162  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0268055  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2500  Ribosomal protein L44E  79.79 
 
 		 93 aa  160  8.000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0872  Ribosomal protein L44E  74.47 
 
 		 93 aa  152  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1011  50S ribosomal protein L44e  71.28 
 
 		 93 aa  142  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1301  50S ribosomal protein L44e  58.51 
 
 		 92 aa  123  7e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1130  50S ribosomal protein L44e  57.45 
 
 		 92 aa  120  9e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.888334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1394  50S ribosomal protein L44e  57.45 
 
 		 92 aa  117  7.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00510964  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1953  50S ribosomal protein L44e  55.32 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.676794 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0955  50S ribosomal protein L44e  56.38 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.836007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1569  50S ribosomal protein L44e  54.26 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0418  50S ribosomal protein L44e  53.19 
 
 		 93 aa  106  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.258932  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2049  50S ribosomal protein L44e  53.19 
 
 		 92 aa  98.2  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0962  50S ribosomal protein L44e  40.62 
 
 		 93 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.243844  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0984  50S ribosomal protein L44e  40.62 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1011  50S ribosomal protein L44e  40.62 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0701  50S ribosomal protein L44e  40 
 
 		 94 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.819978  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1697  50S ribosomal protein L44e  41.11 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2021  Ribosomal protein L44E  34.34 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.157519  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1154  Ribosomal protein L44E  37.23 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0644  50S ribosomal protein L44e  35.11 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000000450289  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1785  50S ribosomal protein L44e  31.96 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0270712 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1361  50S ribosomal protein L44e  34.04 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.170181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1804  50S ribosomal protein L44e  29.29 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1685  50S ribosomal protein L44e  30.93 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.826893  normal  0.690039 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0435  50S ribosomal protein L44e  30.93 
 
 		 91 aa  50.8  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1579  50S ribosomal protein L44e  30.43 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28038  Ribosomal protein L36a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  29.79 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.265485 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0993  50S ribosomal protein L44e  29.55 
 
 		 83 aa  42  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>