32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0644 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0644  50S ribosomal protein L44e  100 
 
 		 95 aa  184  5e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000000450289  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2021  Ribosomal protein L44E  75.79 
 
 		 95 aa  140  4e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.157519  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1804  50S ribosomal protein L44e  64.21 
 
 		 95 aa  127  5.0000000000000004e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1361  50S ribosomal protein L44e  67.39 
 
 		 94 aa  120  6e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.170181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1685  50S ribosomal protein L44e  60.44 
 
 		 91 aa  107  5e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.826893  normal  0.690039 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0435  50S ribosomal protein L44e  59.34 
 
 		 91 aa  103  7e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1785  50S ribosomal protein L44e  58.24 
 
 		 91 aa  102  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0270712 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0993  50S ribosomal protein L44e  60.98 
 
 		 83 aa  97.1  8e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1579  50S ribosomal protein L44e  49.45 
 
 		 93 aa  92  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28038  Ribosomal protein L36a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  43.33 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.265485 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_8185  predicted protein  43.75 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.484224  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06181  60S ribosomal protein L44 P (Broad)  50 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81825  60S ribosomal protein L44  51.32 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0270897  normal  0.128685 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1154  Ribosomal protein L44E  39.13 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2878  Ribosomal protein L44E  35.11 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.362211 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2500  Ribosomal protein L44E  35.48 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0872  Ribosomal protein L44E  36.56 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2788  50S ribosomal protein L44e  32.26 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0268055  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1394  50S ribosomal protein L44e  37.63 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00510964  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0962  50S ribosomal protein L44e  38.3 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.243844  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0418  50S ribosomal protein L44e  34.41 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.258932  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1301  50S ribosomal protein L44e  35.87 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0984  50S ribosomal protein L44e  37.23 
 
 		 93 aa  50.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0955  50S ribosomal protein L44e  33.7 
 
 		 92 aa  50.8  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.836007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1011  50S ribosomal protein L44e  37.23 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1697  50S ribosomal protein L44e  38.64 
 
 		 87 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0701  50S ribosomal protein L44e  37.5 
 
 		 94 aa  49.7  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.819978  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1130  50S ribosomal protein L44e  32.61 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.888334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1953  50S ribosomal protein L44e  31.52 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.676794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1569  50S ribosomal protein L44e  33.7 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2049  50S ribosomal protein L44e  33.7 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1011  50S ribosomal protein L44e  32.63 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>