29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1697 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0962  50S ribosomal protein L44e  100 
 
 		 93 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.243844  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0984  50S ribosomal protein L44e  98.85 
 
 		 93 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1697  50S ribosomal protein L44e  100 
 
 		 87 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1011  50S ribosomal protein L44e  91.95 
 
 		 93 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0701  50S ribosomal protein L44e  88.51 
 
 		 94 aa  165  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.819978  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1154  Ribosomal protein L44E  64.71 
 
 		 94 aa  98.6  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1301  50S ribosomal protein L44e  53.41 
 
 		 92 aa  87.8  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2500  Ribosomal protein L44E  47.19 
 
 		 93 aa  82  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1953  50S ribosomal protein L44e  48.24 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.676794 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0872  Ribosomal protein L44E  44.94 
 
 		 93 aa  77.4  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1130  50S ribosomal protein L44e  48.24 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.888334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0955  50S ribosomal protein L44e  48.24 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.836007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0418  50S ribosomal protein L44e  47.06 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.258932  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1394  50S ribosomal protein L44e  47.06 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00510964  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2049  50S ribosomal protein L44e  47.06 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2878  Ribosomal protein L44E  41.11 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.362211 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1011  50S ribosomal protein L44e  42.22 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2788  50S ribosomal protein L44e  39.33 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0268055  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1804  50S ribosomal protein L44e  43.53 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1569  50S ribosomal protein L44e  42.35 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2021  Ribosomal protein L44E  42.05 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.157519  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28038  Ribosomal protein L36a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  39.76 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.265485 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0435  50S ribosomal protein L44e  39.08 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1685  50S ribosomal protein L44e  37.93 
 
 		 91 aa  50.8  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.826893  normal  0.690039 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1361  50S ribosomal protein L44e  37.5 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.170181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1785  50S ribosomal protein L44e  40.58 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0270712 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0644  50S ribosomal protein L44e  38.64 
 
 		 95 aa  49.7  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000000450289  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0993  50S ribosomal protein L44e  36.9 
 
 		 83 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_8185  predicted protein  39.39 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.484224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>