24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_28038 on replicon NC_009370
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009370  OSTLU_28038  Ribosomal protein L36a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  100 
 
 		 103 aa  207  4e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.265485 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_8185  predicted protein  73.12 
 
 		 100 aa  132  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.484224  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06181  60S ribosomal protein L44 P (Broad)  74.49 
 
 		 106 aa  127  6e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81825  60S ribosomal protein L44  71.72 
 
 		 106 aa  127  7.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0270897  normal  0.128685 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0644  50S ribosomal protein L44e  43.33 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000000450289  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1154  Ribosomal protein L44E  38.89 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1361  50S ribosomal protein L44e  37.78 
 
 		 94 aa  66.6  0.00000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.170181  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2021  Ribosomal protein L44E  45.95 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.157519  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1579  50S ribosomal protein L44e  40 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1804  50S ribosomal protein L44e  38.89 
 
 		 95 aa  62  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1785  50S ribosomal protein L44e  36.78 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0270712 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1685  50S ribosomal protein L44e  33.33 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.826893  normal  0.690039 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1697  50S ribosomal protein L44e  39.76 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0701  50S ribosomal protein L44e  36.56 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.819978  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0435  50S ribosomal protein L44e  33.33 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0984  50S ribosomal protein L44e  39.76 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0962  50S ribosomal protein L44e  39.76 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.243844  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1011  50S ribosomal protein L44e  38.82 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0993  50S ribosomal protein L44e  33.33 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1394  50S ribosomal protein L44e  35.48 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00510964  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2878  Ribosomal protein L44E  29.79 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.362211 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1569  50S ribosomal protein L44e  33.33 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1011  50S ribosomal protein L44e  30.49 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1130  50S ribosomal protein L44e  30.77 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.888334  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>