21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_06181 on replicon BN001301
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06181  60S ribosomal protein L44 P (Broad)  100 
 
 
106 aa  210  4.9999999999999996e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81825  60S ribosomal protein L44  88.68 
 
 
106 aa  167  5e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0270897  normal  0.128685 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_8185  predicted protein  79.21 
 
 
100 aa  152  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.484224  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28038  Ribosomal protein L36a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  74.49 
 
 
103 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.265485 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0644  50S ribosomal protein L44e  50 
 
 
95 aa  70.1  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000000450289  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1579  50S ribosomal protein L44e  45.65 
 
 
93 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1785  50S ribosomal protein L44e  43.82 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0270712 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2021  Ribosomal protein L44E  47.37 
 
 
95 aa  67.4  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.157519  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1361  50S ribosomal protein L44e  40.22 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.170181  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0435  50S ribosomal protein L44e  42.7 
 
 
91 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1685  50S ribosomal protein L44e  41.57 
 
 
91 aa  64.7  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.826893  normal  0.690039 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1804  50S ribosomal protein L44e  43.01 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0993  50S ribosomal protein L44e  43.37 
 
 
83 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1154  Ribosomal protein L44E  39.13 
 
 
94 aa  60.5  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0984  50S ribosomal protein L44e  42.62 
 
 
93 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1011  50S ribosomal protein L44e  42.03 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0962  50S ribosomal protein L44e  42.62 
 
 
93 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.243844  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1697  50S ribosomal protein L44e  42.62 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0701  50S ribosomal protein L44e  38.96 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.819978  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2878  Ribosomal protein L44E  33.75 
 
 
94 aa  40.8  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.362211 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1394  50S ribosomal protein L44e  35.79 
 
 
92 aa  40.4  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00510964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>