20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0993 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0993  50S ribosomal protein L44e  100 
 
 		 83 aa  170  6.999999999999999e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1685  50S ribosomal protein L44e  92.77 
 
 		 91 aa  161  3e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.826893  normal  0.690039 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0435  50S ribosomal protein L44e  91.46 
 
 		 91 aa  157  5e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1785  50S ribosomal protein L44e  89.16 
 
 		 91 aa  154  3e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0270712 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1361  50S ribosomal protein L44e  65.85 
 
 		 94 aa  114  5e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.170181  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2021  Ribosomal protein L44E  69.51 
 
 		 95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.157519  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1804  50S ribosomal protein L44e  64.63 
 
 		 95 aa  103  7e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0644  50S ribosomal protein L44e  60.98 
 
 		 95 aa  97.1  8e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000000450289  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1579  50S ribosomal protein L44e  47.56 
 
 		 93 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1154  Ribosomal protein L44E  38.55 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_8185  predicted protein  36.59 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.484224  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06181  60S ribosomal protein L44 P (Broad)  43.37 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0701  50S ribosomal protein L44e  38.1 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.819978  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28038  Ribosomal protein L36a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  33.33 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.265485 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0962  50S ribosomal protein L44e  36.9 
 
 		 93 aa  47.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.243844  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1697  50S ribosomal protein L44e  36.9 
 
 		 87 aa  47.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0984  50S ribosomal protein L44e  35.71 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1011  50S ribosomal protein L44e  36.9 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81825  60S ribosomal protein L44  40.96 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0270897  normal  0.128685 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2878  Ribosomal protein L44E  29.55 
 
 		 94 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.362211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>