27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0418 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0418  50S ribosomal protein L44e  100 
 
 		 93 aa  191  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.258932  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1569  50S ribosomal protein L44e  64.13 
 
 		 92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1130  50S ribosomal protein L44e  61.96 
 
 		 92 aa  123  9e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.888334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1394  50S ribosomal protein L44e  60.87 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00510964  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1953  50S ribosomal protein L44e  57.61 
 
 		 92 aa  118  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.676794 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1301  50S ribosomal protein L44e  58.7 
 
 		 92 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0955  50S ribosomal protein L44e  56.52 
 
 		 92 aa  113  8.999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.836007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2049  50S ribosomal protein L44e  57.61 
 
 		 92 aa  110  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2788  50S ribosomal protein L44e  54.84 
 
 		 93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0268055  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2878  Ribosomal protein L44E  53.19 
 
 		 94 aa  106  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.362211 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1011  50S ribosomal protein L44e  53.76 
 
 		 93 aa  100  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2500  Ribosomal protein L44E  48.39 
 
 		 93 aa  95.1  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0872  Ribosomal protein L44E  46.24 
 
 		 93 aa  91.3  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0984  50S ribosomal protein L44e  45.74 
 
 		 93 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0962  50S ribosomal protein L44e  46.81 
 
 		 93 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.243844  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1011  50S ribosomal protein L44e  44.68 
 
 		 93 aa  77  0.00000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0701  50S ribosomal protein L44e  45.16 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.819978  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1697  50S ribosomal protein L44e  47.06 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1154  Ribosomal protein L44E  45.74 
 
 		 94 aa  72.4  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1579  50S ribosomal protein L44e  41.3 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2021  Ribosomal protein L44E  38.78 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.157519  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1804  50S ribosomal protein L44e  35.71 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0644  50S ribosomal protein L44e  34.41 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000000450289  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1361  50S ribosomal protein L44e  33.7 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.170181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1785  50S ribosomal protein L44e  34.02 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0270712 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0435  50S ribosomal protein L44e  34.02 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1685  50S ribosomal protein L44e  32.99 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.826893  normal  0.690039 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>