26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0872 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0872  Ribosomal protein L44E  100 
 
 		 93 aa  193  5.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2500  Ribosomal protein L44E  93.55 
 
 		 93 aa  185  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2878  Ribosomal protein L44E  74.47 
 
 		 94 aa  152  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.362211 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2788  50S ribosomal protein L44e  73.12 
 
 		 93 aa  146  9e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0268055  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1011  50S ribosomal protein L44e  68.82 
 
 		 93 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1301  50S ribosomal protein L44e  56.38 
 
 		 92 aa  117  7e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1130  50S ribosomal protein L44e  54.26 
 
 		 92 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.888334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1953  50S ribosomal protein L44e  52.13 
 
 		 92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.676794 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0955  50S ribosomal protein L44e  50.54 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.836007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1394  50S ribosomal protein L44e  50.54 
 
 		 92 aa  102  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00510964  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2049  50S ribosomal protein L44e  52.13 
 
 		 92 aa  97.4  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1569  50S ribosomal protein L44e  46.24 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0418  50S ribosomal protein L44e  46.24 
 
 		 93 aa  91.3  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.258932  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0962  50S ribosomal protein L44e  44.21 
 
 		 93 aa  82.8  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.243844  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0984  50S ribosomal protein L44e  44.21 
 
 		 93 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1011  50S ribosomal protein L44e  42.11 
 
 		 93 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1697  50S ribosomal protein L44e  44.94 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0701  50S ribosomal protein L44e  39.36 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.819978  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1154  Ribosomal protein L44E  40.86 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2021  Ribosomal protein L44E  34.69 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.157519  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0644  50S ribosomal protein L44e  36.56 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000000450289  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1804  50S ribosomal protein L44e  29.59 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1361  50S ribosomal protein L44e  36.56 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.170181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1785  50S ribosomal protein L44e  31.25 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0270712 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1685  50S ribosomal protein L44e  30.21 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.826893  normal  0.690039 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0435  50S ribosomal protein L44e  30.21 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>