26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2500 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2500  Ribosomal protein L44E  100 
 
 
93 aa  194  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0872  Ribosomal protein L44E  93.55 
 
 
93 aa  185  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2878  Ribosomal protein L44E  79.79 
 
 
94 aa  160  8.000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.362211 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1011  50S ribosomal protein L44e  74.19 
 
 
93 aa  152  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2788  50S ribosomal protein L44e  75.27 
 
 
93 aa  151  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0268055  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1301  50S ribosomal protein L44e  55.91 
 
 
92 aa  120  8e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1130  50S ribosomal protein L44e  53.76 
 
 
92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.888334  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1953  50S ribosomal protein L44e  51.61 
 
 
92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.676794 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1394  50S ribosomal protein L44e  53.76 
 
 
92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00510964  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0955  50S ribosomal protein L44e  50.54 
 
 
92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.836007  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1569  50S ribosomal protein L44e  49.46 
 
 
92 aa  99.4  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2049  50S ribosomal protein L44e  52.13 
 
 
92 aa  99  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0418  50S ribosomal protein L44e  48.39 
 
 
93 aa  95.1  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.258932  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0962  50S ribosomal protein L44e  46.32 
 
 
93 aa  87.4  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.243844  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0984  50S ribosomal protein L44e  46.32 
 
 
93 aa  87.4  7e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1011  50S ribosomal protein L44e  44.21 
 
 
93 aa  83.6  9e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1697  50S ribosomal protein L44e  47.19 
 
 
87 aa  82  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0701  50S ribosomal protein L44e  40.43 
 
 
94 aa  77  0.00000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.819978  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1154  Ribosomal protein L44E  43.01 
 
 
94 aa  70.9  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2021  Ribosomal protein L44E  34.69 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.157519  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0644  50S ribosomal protein L44e  35.48 
 
 
95 aa  55.1  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000000450289  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1804  50S ribosomal protein L44e  29.59 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1361  50S ribosomal protein L44e  34.41 
 
 
94 aa  51.6  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.170181  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1785  50S ribosomal protein L44e  30.21 
 
 
91 aa  50.8  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0270712 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1685  50S ribosomal protein L44e  29.17 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.826893  normal  0.690039 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0435  50S ribosomal protein L44e  29.17 
 
 
91 aa  47.4  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>