65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1885 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1885  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  309  9e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3182  hypothetical protein  30.57 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3716  hypothetical protein  31.17 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00909432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0414  hypothetical protein  30.52 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3541  hypothetical protein  30.52 
 
 		 153 aa  67  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.205481  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1197  hypothetical protein  27.81 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4189  hypothetical protein  30.38 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4077  hypothetical protein  31.11 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0251  hypothetical protein  28.67 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0441  hypothetical protein  29.22 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.187891 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0455  hypothetical protein  29.22 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.210812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0429  hypothetical protein  29.22 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240308  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3885  hypothetical protein  29.22 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.25824  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0516  hypothetical protein  30.37 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4091  hypothetical protein  32.33 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224729 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0479  hypothetical protein  28.39 
 
 		 154 aa  60.1  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3353  hypothetical protein  28.89 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970334 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0569  hypothetical protein  28.89 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1971  hypothetical protein  25.66 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.438499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0546  hypothetical protein  27.08 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0037  hypothetical protein  29.53 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.593227  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3560  hypothetical protein  28.15 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0503  hypothetical protein  29.93 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4189  hypothetical protein  28.57 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219481  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2429  hypothetical protein  27.45 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0950  hypothetical protein  28.1 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.757542  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0893  hypothetical protein  34.55 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0251499  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3550  hypothetical protein  25.81 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3734  hypothetical protein  24 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3685  hypothetical protein  25.81 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4041  hypothetical protein  25.81 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0300  hypothetical protein  29.51 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.280318  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3890  hypothetical protein  32.22 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1405  hypothetical protein  23.33 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1296  hypothetical protein  23.33 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2772  hypothetical protein  23.33 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000928029 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3693  hypothetical protein  31.11 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.757181  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3422  putative mannitol dehydrogenase  27.45 
 
 		 164 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00935563 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3242  hypothetical protein  27.45 
 
 		 164 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3326  putative mannitol dehydrogenase  27.45 
 
 		 164 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.646058  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3318  putative mannitol dehydrogenase  27.45 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.713407 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3569  hypothetical protein  22.67 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0942  hypothetical protein  28.57 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3658  hypothetical protein  27.72 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.152063 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0421  hypothetical protein  24 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0370  hypothetical protein  24 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1574  hypothetical protein  26.05 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259352  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4852  hypothetical protein  27.19 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1802  hypothetical protein  26.05 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.149965 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1468  hypothetical protein  26.05 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4073  hypothetical protein  28.06 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3780  hypothetical protein  30 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0697  hypothetical protein  26.61 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000264124  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03379  hypothetical protein  30 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0138  hypothetical protein  30 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4753  putative cytoplasmic protein  27.19 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4723  putative cytoplasmic protein  27.19 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.229528 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4871  hypothetical protein  27.19 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.367962  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03428  hypothetical protein  30 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3899  hypothetical protein  30 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1482  hypothetical protein  26.67 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4816  putative cytoplasmic protein  27.19 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.686485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4833  hypothetical protein  23.33 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0134  conserved hypothetical protein  28.89 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5192  hypothetical protein  23.87 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>