108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3541 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3541  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  317  5e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.205481  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0414  hypothetical protein  99.35 
 
 
153 aa  315  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3716  hypothetical protein  98.69 
 
 
153 aa  313  7e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00909432  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4189  hypothetical protein  94.12 
 
 
153 aa  302  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3885  hypothetical protein  89.54 
 
 
153 aa  289  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.25824  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0441  hypothetical protein  89.54 
 
 
153 aa  289  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.187891 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0455  hypothetical protein  89.54 
 
 
153 aa  289  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.210812  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0429  hypothetical protein  88.89 
 
 
153 aa  287  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240308  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0479  hypothetical protein  81.7 
 
 
154 aa  267  5e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0516  hypothetical protein  86.71 
 
 
153 aa  259  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3560  hypothetical protein  81.56 
 
 
153 aa  244  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3353  hypothetical protein  77.3 
 
 
153 aa  229  8.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970334 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0569  hypothetical protein  73.94 
 
 
153 aa  228  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0546  hypothetical protein  70.42 
 
 
153 aa  221  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4077  hypothetical protein  70.42 
 
 
153 aa  213  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0503  hypothetical protein  58.87 
 
 
153 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4091  hypothetical protein  45.93 
 
 
151 aa  122  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224729 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1197  hypothetical protein  40.91 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1971  hypothetical protein  37.01 
 
 
151 aa  100  9e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.438499  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1296  hypothetical protein  34.87 
 
 
156 aa  90.9  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2429  hypothetical protein  34.42 
 
 
152 aa  89  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2772  hypothetical protein  34.21 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000928029 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1405  hypothetical protein  34.21 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3693  hypothetical protein  37.91 
 
 
157 aa  89  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.757181  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5192  hypothetical protein  32.47 
 
 
159 aa  86.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3890  hypothetical protein  37.91 
 
 
157 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3867  YiaL  34.04 
 
 
154 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3883  YiaL  34 
 
 
154 aa  84  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3947  hypothetical protein  34 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3992  hypothetical protein  34 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.361661  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4054  hypothetical protein  34 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60662  normal  0.509772 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03428  hypothetical protein  32.67 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0138  hypothetical protein  32.67 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03379  hypothetical protein  32.67 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3780  hypothetical protein  32.85 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0134  conserved hypothetical protein  32 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3934  hypothetical protein  34.42 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0893  hypothetical protein  33.99 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0251499  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4073  hypothetical protein  32 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3899  hypothetical protein  32 
 
 
155 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1482  hypothetical protein  31.58 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0300  hypothetical protein  31.21 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.280318  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1161  hypothetical protein  29.41 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1468  hypothetical protein  32.69 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1802  hypothetical protein  32.69 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.149965 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1574  hypothetical protein  32.69 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259352  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3658  hypothetical protein  34.45 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.152063 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3182  hypothetical protein  31.87 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0180  hypothetical protein  31.37 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3526  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4126  hypothetical protein  30.28 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0177  hypothetical protein  30.72 
 
 
150 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3550  hypothetical protein  25.97 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4041  hypothetical protein  25.97 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3685  hypothetical protein  25.97 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3633  hypothetical protein  32.48 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.792546 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3528  putative cytoplasmic protein  32.48 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3598  putative cytoplasmic protein  31.62 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3695  hypothetical protein  31.62 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0938  hypothetical protein  31.21 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.455513  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0942  hypothetical protein  30.43 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3569  hypothetical protein  27.63 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3734  hypothetical protein  26.97 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0950  hypothetical protein  32.05 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.757542  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0453  hypothetical protein  28 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0303591 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0251  hypothetical protein  31.41 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3326  putative mannitol dehydrogenase  32.2 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.646058  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3318  putative mannitol dehydrogenase  32.2 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.713407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3242  hypothetical protein  32.2 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3422  putative mannitol dehydrogenase  32.2 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00935563 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1885  hypothetical protein  30.52 
 
 
150 aa  67  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4732  hypothetical protein  25.68 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.750065  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4833  hypothetical protein  25.68 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4723  putative cytoplasmic protein  25.66 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.229528 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3541  hypothetical protein  31.54 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.165984  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04118  hypothetical protein  25.68 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4823  hypothetical protein  25.68 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3761  hypothetical protein  25.68 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.790206  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4871  hypothetical protein  25.66 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.367962  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4753  putative cytoplasmic protein  25.66 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5773  hypothetical protein  25.68 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04082  hypothetical protein  25.68 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03081  hypothetical protein  32.54 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3409  hypothetical protein  32.54 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0485  hypothetical protein  32.54 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.940731 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4816  putative cytoplasmic protein  25.66 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.686485  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03032  hypothetical protein  32.54 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4507  hypothetical protein  25.68 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0631988  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4852  hypothetical protein  25 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4538  hypothetical protein  32.54 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0485  conserved hypothetical protein  32.54 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3712  hypothetical protein  30.77 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4189  hypothetical protein  28.39 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219481  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3703  hypothetical protein  32.54 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3516  hypothetical protein  32.54 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3745  conserved hypothetical protein  25 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0421  hypothetical protein  25 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2381  hypothetical protein  34.13 
 
 
169 aa  62.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00279399  normal  0.781937 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0685  hypothetical protein  30.32 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0370  hypothetical protein  25.66 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>