106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4852 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4852  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  313  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4816  putative cytoplasmic protein  98 
 
 		 150 aa  308  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.686485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4871  hypothetical protein  98 
 
 		 150 aa  308  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.367962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4723  putative cytoplasmic protein  98 
 
 		 150 aa  308  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.229528 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4753  putative cytoplasmic protein  97.33 
 
 		 150 aa  306  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4833  hypothetical protein  82 
 
 		 150 aa  261  3e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04118  hypothetical protein  82 
 
 		 150 aa  260  4e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04082  hypothetical protein  82 
 
 		 150 aa  260  4e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4823  hypothetical protein  81.33 
 
 		 150 aa  259  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3761  hypothetical protein  81.33 
 
 		 150 aa  259  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.790206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5773  hypothetical protein  81.33 
 
 		 150 aa  259  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4507  hypothetical protein  80.67 
 
 		 150 aa  257  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0631988  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3745  conserved hypothetical protein  80.67 
 
 		 150 aa  257  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4732  hypothetical protein  80.67 
 
 		 150 aa  256  6e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.750065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0453  hypothetical protein  74 
 
 		 150 aa  238  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0303591 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3550  hypothetical protein  67.11 
 
 		 152 aa  207  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3685  hypothetical protein  67.11 
 
 		 152 aa  207  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3734  hypothetical protein  65.77 
 
 		 155 aa  207  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4041  hypothetical protein  66.44 
 
 		 152 aa  204  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3569  hypothetical protein  63.76 
 
 		 155 aa  198  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0370  hypothetical protein  64.43 
 
 		 154 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0421  hypothetical protein  64.43 
 
 		 154 aa  197  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1161  hypothetical protein  42.67 
 
 		 156 aa  116  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5192  hypothetical protein  41.45 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3326  putative mannitol dehydrogenase  37.09 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.646058  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0938  hypothetical protein  37.69 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.455513  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3318  putative mannitol dehydrogenase  38.16 
 
 		 157 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.713407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3242  hypothetical protein  38.16 
 
 		 164 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3422  putative mannitol dehydrogenase  38.16 
 
 		 164 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00935563 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0685  hypothetical protein  39.22 
 
 		 161 aa  95.5  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3633  hypothetical protein  40 
 
 		 155 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.792546 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3528  putative cytoplasmic protein  40 
 
 		 155 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3598  putative cytoplasmic protein  40 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3695  hypothetical protein  40 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3526  hypothetical protein  39.13 
 
 		 155 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0300  hypothetical protein  38.35 
 
 		 159 aa  90.9  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.280318  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0643  hypothetical protein  37.33 
 
 		 157 aa  86.7  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0956559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4538  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1971  hypothetical protein  32.45 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.438499  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0485  conserved hypothetical protein  32.62 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3703  hypothetical protein  32.62 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3516  hypothetical protein  32.62 
 
 		 154 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3541  hypothetical protein  36.13 
 
 		 155 aa  83.6  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.165984  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03081  hypothetical protein  32.62 
 
 		 154 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3409  hypothetical protein  32.62 
 
 		 154 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0485  hypothetical protein  32.62 
 
 		 154 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.940731 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3712  hypothetical protein  35.53 
 
 		 155 aa  83.6  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03032  hypothetical protein  32.62 
 
 		 154 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3555  hypothetical protein  31.91 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0180  hypothetical protein  30.92 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0177  hypothetical protein  30.92 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0893  hypothetical protein  29.33 
 
 		 156 aa  80.1  0.000000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0251499  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4126  hypothetical protein  29.93 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2772  hypothetical protein  29.53 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000928029 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1405  hypothetical protein  29.53 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1296  hypothetical protein  29.53 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0479  hypothetical protein  28.95 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1468  hypothetical protein  30.88 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1802  hypothetical protein  30.88 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.149965 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1574  hypothetical protein  30.88 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259352  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3947  hypothetical protein  30.2 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3992  hypothetical protein  30.2 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.361661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3883  YiaL  30.2 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4054  hypothetical protein  30.2 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60662  normal  0.509772 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3658  hypothetical protein  29.82 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.152063 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03428  hypothetical protein  27.81 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0138  hypothetical protein  27.81 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03379  hypothetical protein  27.81 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3890  hypothetical protein  27.63 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3780  hypothetical protein  26.81 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4073  hypothetical protein  27.15 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1492  hypothetical protein  28.48 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78533 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3867  YiaL  29.53 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0134  conserved hypothetical protein  27.15 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0251  hypothetical protein  28.67 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3899  hypothetical protein  27.15 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4189  hypothetical protein  26.32 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3934  hypothetical protein  26.32 
 
 		 156 aa  67  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3716  hypothetical protein  25 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00909432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3541  hypothetical protein  25 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.205481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0414  hypothetical protein  25 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3885  hypothetical protein  27.45 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.25824  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0441  hypothetical protein  27.45 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.187891 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0455  hypothetical protein  27.45 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.210812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3693  hypothetical protein  25.66 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.757181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0429  hypothetical protein  27.45 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240308  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1197  hypothetical protein  26.21 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0546  hypothetical protein  28.07 
 
 		 153 aa  62  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0697  hypothetical protein  25.83 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000264124  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2429  hypothetical protein  29.22 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0516  hypothetical protein  25.87 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0942  hypothetical protein  28.67 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0950  hypothetical protein  30.92 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.757542  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1482  hypothetical protein  26.09 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3560  hypothetical protein  25.93 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0503  hypothetical protein  26.67 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4077  hypothetical protein  24.44 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0569  hypothetical protein  24.44 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3353  hypothetical protein  22.96 
 
 		 153 aa  52  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970334 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3182  hypothetical protein  31.01 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>