51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1227 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1227  protein of unknown function DUF477  100 
 
 		 215 aa  432  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1420  protein of unknown function DUF477  71.63 
 
 		 215 aa  320  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.35065 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1258  protein of unknown function DUF477  77.67 
 
 		 215 aa  294  8e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.255338  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1771  hypothetical protein  26.2 
 
 		 251 aa  75.1  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2528  hypothetical protein  26.11 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0293183  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0415  protein of unknown function DUF477  28.9 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2030  protein of unknown function DUF477  29.14 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0813  hypothetical protein  26.64 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2034  hypothetical protein  25.82 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1822  protein of unknown function DUF477  24.53 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0121907  normal  0.874997 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2362  protein of unknown function DUF477  27.44 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0549587  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4288  hypothetical protein  26.19 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1300  hypothetical protein  24.29 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0959913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2025  protein of unknown function DUF477  24.43 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1373  hypothetical protein  26.48 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000592916  hitchhiker  0.000147717 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1045  hypothetical protein  26.89 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2278  hypothetical protein  25.71 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166997  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0869  hypothetical protein  29.89 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2020  hypothetical protein  24.22 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000109583  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3991  hypothetical protein  26.51 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296881  normal  0.226333 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2421  protein of unknown function DUF477  25.58 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0918  protein of unknown function DUF477  29.89 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0411456  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0914  protein of unknown function DUF477  29.31 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4407  hypothetical protein  26.44 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.809369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1796  protein of unknown function DUF477  25.23 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0823313 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4319  hypothetical protein  25.85 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1479  hypothetical protein  30.86 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0815961  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1223  protein of unknown function DUF477  33.01 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1820  hypothetical protein  21.88 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311649  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1752  hypothetical protein  21.88 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3876  hypothetical protein  27.27 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.782004  normal  0.0344553 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4748  hypothetical protein  28.57 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0550887 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0926  hypothetical protein  38.03 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.297629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1404  hypothetical protein  25.12 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2295  protein of unknown function DUF477  27.17 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345747 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47050  hypothetical protein  23.53 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2018  hypothetical protein  27.17 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1083  hypothetical protein  25.41 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04651  hypothetical protein  31.31 
 
 		 143 aa  45.4  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.024621  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3400  hypothetical protein  30.93 
 
 		 165 aa  45.1  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.358552  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1072  hypothetical protein  25 
 
 		 173 aa  45.1  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1763  protein of unknown function DUF477  29.59 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.479141  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4855  protein of unknown function DUF477  24.48 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1402  protein of unknown function DUF477  26.8 
 
 		 151 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1230  protein of unknown function DUF477  32.22 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0298184 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0104  hypothetical protein  27.84 
 
 		 173 aa  43.9  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1980  protein of unknown function DUF477  28.26 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3481  hypothetical protein  33.33 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0395  hypothetical protein  20.64 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6374  hypothetical protein  29.86 
 
 		 210 aa  42  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3228  hypothetical protein  23.92 
 
 		 213 aa  41.6  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>