54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0548 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0548  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  713    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0675  hypothetical protein  77.55 
 
 		 343 aa  566  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.575182  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0454  hypothetical protein  75.59 
 
 		 343 aa  552  1e-156  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1681  hypothetical protein  72.94 
 
 		 347 aa  538  9.999999999999999e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0795  hypothetical protein  74.63 
 
 		 345 aa  537  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0695397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2218  hypothetical protein  75.81 
 
 		 347 aa  526  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1414  hypothetical protein  72.27 
 
 		 343 aa  507  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1656  hypothetical protein  44.02 
 
 		 360 aa  302  7.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00119867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2984  hypothetical protein  42.77 
 
 		 354 aa  281  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1492  hypothetical protein  39.42 
 
 		 347 aa  281  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286308  normal  0.0796091 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2062  hypothetical protein  42.52 
 
 		 362 aa  280  3e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0466  hypothetical protein  41.64 
 
 		 351 aa  277  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3289  hypothetical protein  40.06 
 
 		 366 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.60491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3197  hypothetical protein  40.94 
 
 		 346 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0480  hypothetical protein  40.76 
 
 		 349 aa  271  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3720  hypothetical protein  40.18 
 
 		 346 aa  270  4e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.588173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3546  hypothetical protein  39.88 
 
 		 346 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0410  hypothetical protein  39.88 
 
 		 346 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4072  hypothetical protein  37.54 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0511  hypothetical protein  39.41 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3787  hypothetical protein  39.47 
 
 		 351 aa  260  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4194  hypothetical protein  39.47 
 
 		 346 aa  260  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3367  hypothetical protein  38.42 
 
 		 350 aa  258  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0436  hypothetical protein  39.2 
 
 		 346 aa  255  9e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.574558  hitchhiker  0.00210413 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0450  hypothetical protein  38.92 
 
 		 346 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3890  hypothetical protein  38.73 
 
 		 346 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877982  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0424  hypothetical protein  38.73 
 
 		 346 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00208  glycosyl transferase  37.09 
 
 		 349 aa  249  4e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0533  hypothetical protein  38.53 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00822  hypothetical protein  39.59 
 
 		 348 aa  247  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001652  glycosyltransferase  39.59 
 
 		 348 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3812  glycosyltransferase-distantly-related protein  31.23 
 
 		 346 aa  156  6e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4031  hypothetical protein  30.95 
 
 		 328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.510364  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0336  teichoic acid biosynthesis related protein  30.72 
 
 		 355 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2842  UDP-glucuronosyltransferase-like protein  29.19 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6653  putative UDP-glucuronosyltransferase  28.31 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.109077 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1851  hypothetical protein  28.98 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.316148  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0449  Glycosyltransferase 28 domain protein  30.19 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1235  teichoic acid biosynthesis related protein  29.54 
 
 		 360 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2254  teichoic acid biosynthesis related protein  27.3 
 
 		 381 aa  90.9  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.060696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0254  teichoic acid biosynthesis related protein  27.49 
 
 		 367 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0266168  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0243  teichoic acid biosynthesis related protein  27.79 
 
 		 367 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0253  teichoic acid biosynthesis related protein  28.07 
 
 		 366 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2563  UDP- glucuronosyltransferase-like glycosyl transferase  25.59 
 
 		 371 aa  86.7  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504516  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0232  teichoic acid biosynthesis related protein  27.19 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422227  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2719  teichoic acid biosynthesis related protein  26.75 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.194172  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5685  Glycosyl transferase-like protein UDP- glucuronosyltransferase  24.25 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3660  putative glycosyltransferase  23.91 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359283  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0759  hypothetical protein  32.12 
 
 		 359 aa  47.4  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2159  glycosyltransferase family 28 protein  26.28 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.188732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1442  Glycosyltransferase 28 domain protein  47.83 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5656  hypothetical protein  20.18 
 
 		 364 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3193  hypothetical protein  21.69 
 
 		 337 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321046  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1232  glycosyltransferase  25.2 
 
 		 378 aa  43.5  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>