50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5656 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5656  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  739    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2842  UDP-glucuronosyltransferase-like protein  23.19 
 
 		 371 aa  103  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0336  teichoic acid biosynthesis related protein  25.81 
 
 		 355 aa  102  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0449  Glycosyltransferase 28 domain protein  23.19 
 
 		 377 aa  92  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6653  putative UDP-glucuronosyltransferase  22.84 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.109077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1492  hypothetical protein  27.95 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286308  normal  0.0796091 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3812  glycosyltransferase-distantly-related protein  26.98 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1235  teichoic acid biosynthesis related protein  21.99 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0795  hypothetical protein  24.09 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0695397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0454  hypothetical protein  22.52 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2719  teichoic acid biosynthesis related protein  22.46 
 
 		 388 aa  62.8  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.194172  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2984  hypothetical protein  21.49 
 
 		 354 aa  62  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4072  hypothetical protein  23.28 
 
 		 358 aa  62  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1681  hypothetical protein  23.4 
 
 		 347 aa  62  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2062  hypothetical protein  23.35 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0254  teichoic acid biosynthesis related protein  21.45 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0266168  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0507  glycosyltransferase family 28 protein  25.33 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0243  teichoic acid biosynthesis related protein  21.53 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1235  glycosyltransferase family 28 protein  24.34 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110659  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0253  teichoic acid biosynthesis related protein  19.83 
 
 		 366 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0675  hypothetical protein  21.11 
 
 		 343 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.575182  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2254  teichoic acid biosynthesis related protein  23.15 
 
 		 381 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.060696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1414  hypothetical protein  21.75 
 
 		 343 aa  54.7  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1401  glycosyltransferase family 28 protein  25 
 
 		 361 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0548  hypothetical protein  22.12 
 
 		 343 aa  53.9  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2218  hypothetical protein  22.17 
 
 		 347 aa  53.5  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2009  glycosyltransferase  22.38 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0518104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1656  hypothetical protein  21.74 
 
 		 360 aa  50.4  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00119867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0533  hypothetical protein  22.68 
 
 		 350 aa  49.7  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3660  putative glycosyltransferase  20.43 
 
 		 373 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359283  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00822  hypothetical protein  24.47 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3787  hypothetical protein  22.22 
 
 		 351 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0424  hypothetical protein  26.32 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0511  hypothetical protein  21.05 
 
 		 346 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0436  hypothetical protein  26.32 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.574558  hitchhiker  0.00210413 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3890  hypothetical protein  26.32 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877982  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0450  hypothetical protein  26.32 
 
 		 346 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3367  hypothetical protein  22.03 
 
 		 350 aa  47  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1442  Glycosyltransferase 28 domain protein  30.91 
 
 		 352 aa  46.6  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4194  hypothetical protein  21.82 
 
 		 346 aa  46.6  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0480  hypothetical protein  21.26 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001652  glycosyltransferase  22.49 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5685  Glycosyl transferase-like protein UDP- glucuronosyltransferase  20.17 
 
 		 382 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3720  hypothetical protein  20.44 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.588173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1232  glycosyltransferase  20.95 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01800  hypothetical protein  21.21 
 
 		 365 aa  44.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4031  hypothetical protein  21.79 
 
 		 328 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.510364  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1391  glycosyltransferase family 28 protein  23.64 
 
 		 361 aa  43.9  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0410  hypothetical protein  21.58 
 
 		 346 aa  42.7  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3546  hypothetical protein  21.58 
 
 		 346 aa  42.7  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279975  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>