57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3660 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3660  putative glycosyltransferase  100 
 
 
373 aa  780    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359283  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2563  UDP- glucuronosyltransferase-like glycosyl transferase  46.38 
 
 
371 aa  335  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5685  Glycosyl transferase-like protein UDP- glucuronosyltransferase  42.18 
 
 
382 aa  310  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0449  Glycosyltransferase 28 domain protein  25.73 
 
 
377 aa  110  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1851  hypothetical protein  27.56 
 
 
359 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.316148  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2719  teichoic acid biosynthesis related protein  26.05 
 
 
388 aa  96.7  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.194172  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0336  teichoic acid biosynthesis related protein  27.36 
 
 
355 aa  94  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1235  teichoic acid biosynthesis related protein  22.68 
 
 
360 aa  86.3  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2842  UDP-glucuronosyltransferase-like protein  25.62 
 
 
371 aa  86.3  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6653  putative UDP-glucuronosyltransferase  25.4 
 
 
359 aa  85.5  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.109077 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2254  teichoic acid biosynthesis related protein  24.1 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.060696  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0450  hypothetical protein  24.48 
 
 
346 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3546  hypothetical protein  23.72 
 
 
346 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279975  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0436  hypothetical protein  24.18 
 
 
346 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.574558  hitchhiker  0.00210413 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0410  hypothetical protein  23.72 
 
 
346 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3890  hypothetical protein  23.88 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877982  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0424  hypothetical protein  23.88 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3720  hypothetical protein  23.72 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.588173  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0232  teichoic acid biosynthesis related protein  22.94 
 
 
367 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422227  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4194  hypothetical protein  24.12 
 
 
346 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0253  teichoic acid biosynthesis related protein  27.37 
 
 
366 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0243  teichoic acid biosynthesis related protein  25.37 
 
 
367 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0511  hypothetical protein  23.26 
 
 
346 aa  72  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4072  hypothetical protein  21.56 
 
 
358 aa  72  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0254  teichoic acid biosynthesis related protein  23.53 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0266168  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0675  hypothetical protein  25.56 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.575182  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3812  glycosyltransferase-distantly-related protein  20.83 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3289  hypothetical protein  23.29 
 
 
366 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.60491  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0795  hypothetical protein  25.73 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0695397  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4031  hypothetical protein  22.08 
 
 
328 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.510364  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3367  hypothetical protein  24.35 
 
 
350 aa  65.1  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2062  hypothetical protein  23.81 
 
 
362 aa  64.7  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1414  hypothetical protein  23.86 
 
 
343 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0454  hypothetical protein  24.56 
 
 
343 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0533  hypothetical protein  22.7 
 
 
350 aa  64.3  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1681  hypothetical protein  23.55 
 
 
347 aa  62.4  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1492  hypothetical protein  21.73 
 
 
347 aa  62.4  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286308  normal  0.0796091 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0548  hypothetical protein  23.91 
 
 
343 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3787  hypothetical protein  23.58 
 
 
351 aa  59.3  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2159  glycosyltransferase family 28 protein  23.58 
 
 
377 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.188732  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1656  hypothetical protein  23.61 
 
 
360 aa  59.3  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00119867  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0466  hypothetical protein  22.86 
 
 
351 aa  58.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3197  hypothetical protein  22.07 
 
 
346 aa  57.4  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0480  hypothetical protein  22.9 
 
 
349 aa  57.4  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2218  hypothetical protein  24.64 
 
 
347 aa  54.7  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2984  hypothetical protein  20.54 
 
 
354 aa  53.5  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1235  glycosyltransferase family 28 protein  22.94 
 
 
361 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110659  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1401  glycosyltransferase family 28 protein  22.02 
 
 
361 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0507  glycosyltransferase family 28 protein  21.89 
 
 
361 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0820  glycosyltransferase family 28 protein  22.98 
 
 
359 aa  49.3  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.601054  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2009  glycosyltransferase  28.47 
 
 
380 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0518104  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1391  glycosyltransferase family 28 protein  23.82 
 
 
361 aa  47.8  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2407  glycosyltransferase  19.37 
 
 
383 aa  46.6  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.245126  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001652  glycosyltransferase  22 
 
 
348 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00208  glycosyl transferase  23.33 
 
 
349 aa  44.3  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1232  glycosyltransferase  19.83 
 
 
378 aa  43.5  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00822  hypothetical protein  20.34 
 
 
348 aa  42.7  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>