58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2254 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2254  teichoic acid biosynthesis related protein  100 
 
 
381 aa  795    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.060696  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1235  teichoic acid biosynthesis related protein  45.11 
 
 
360 aa  298  8e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0449  Glycosyltransferase 28 domain protein  30.08 
 
 
377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0253  teichoic acid biosynthesis related protein  30.71 
 
 
366 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0243  teichoic acid biosynthesis related protein  31.37 
 
 
367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0232  teichoic acid biosynthesis related protein  31.4 
 
 
367 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0254  teichoic acid biosynthesis related protein  30.77 
 
 
367 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0266168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2842  UDP-glucuronosyltransferase-like protein  28.65 
 
 
371 aa  146  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0336  teichoic acid biosynthesis related protein  29.01 
 
 
355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2719  teichoic acid biosynthesis related protein  31.1 
 
 
388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.194172  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6653  putative UDP-glucuronosyltransferase  29.29 
 
 
359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.109077 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0548  hypothetical protein  27.3 
 
 
343 aa  90.9  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1656  hypothetical protein  27.53 
 
 
360 aa  89.7  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00119867  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0454  hypothetical protein  28.21 
 
 
343 aa  89  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0795  hypothetical protein  27.01 
 
 
345 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0695397  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2563  UDP- glucuronosyltransferase-like glycosyl transferase  25.74 
 
 
371 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504516  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0675  hypothetical protein  28.89 
 
 
343 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.575182  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2218  hypothetical protein  26.58 
 
 
347 aa  83.2  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1681  hypothetical protein  26.67 
 
 
347 aa  82  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3289  hypothetical protein  27.78 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.60491  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3660  putative glycosyltransferase  24.1 
 
 
373 aa  80.1  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359283  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4072  hypothetical protein  25.32 
 
 
358 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0820  glycosyltransferase family 28 protein  22.56 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.601054  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1414  hypothetical protein  27.24 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1851  hypothetical protein  24.29 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.316148  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3367  hypothetical protein  26.63 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5685  Glycosyl transferase-like protein UDP- glucuronosyltransferase  23.8 
 
 
382 aa  66.6  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1391  glycosyltransferase family 28 protein  23.15 
 
 
361 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2062  hypothetical protein  25 
 
 
362 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3546  hypothetical protein  26.37 
 
 
346 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279975  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0507  glycosyltransferase family 28 protein  22.49 
 
 
361 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3720  hypothetical protein  26.25 
 
 
346 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.588173  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0410  hypothetical protein  26.37 
 
 
346 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1235  glycosyltransferase family 28 protein  21.59 
 
 
361 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110659  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0466  hypothetical protein  24.07 
 
 
351 aa  63.5  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3197  hypothetical protein  25.08 
 
 
346 aa  63.5  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1401  glycosyltransferase family 28 protein  20.74 
 
 
361 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3787  hypothetical protein  24.68 
 
 
351 aa  62.4  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4031  hypothetical protein  22.22 
 
 
328 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.510364  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1492  hypothetical protein  22.22 
 
 
347 aa  61.6  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286308  normal  0.0796091 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4194  hypothetical protein  25.16 
 
 
346 aa  61.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0533  hypothetical protein  24.12 
 
 
350 aa  60.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3812  glycosyltransferase-distantly-related protein  22.96 
 
 
346 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1232  glycosyltransferase  24.17 
 
 
378 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0511  hypothetical protein  24.19 
 
 
346 aa  57.4  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00822  hypothetical protein  23.22 
 
 
348 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001652  glycosyltransferase  23.51 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0480  hypothetical protein  23.75 
 
 
349 aa  53.9  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00208  glycosyl transferase  23.18 
 
 
349 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3890  hypothetical protein  24.34 
 
 
346 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877982  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5656  hypothetical protein  36.76 
 
 
364 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0450  hypothetical protein  23.15 
 
 
346 aa  49.7  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0424  hypothetical protein  24.01 
 
 
346 aa  49.7  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0436  hypothetical protein  23.49 
 
 
346 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.574558  hitchhiker  0.00210413 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0692  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  23.68 
 
 
339 aa  46.6  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0716  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  23.31 
 
 
339 aa  46.2  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2009  glycosyltransferase  48 
 
 
380 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0518104  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2497  glycosyltransferase, MGT family  22.05 
 
 
380 aa  42.7  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>