56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4072 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4072  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  744    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00208  glycosyl transferase  55.95 
 
 		 349 aa  389  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2062  hypothetical protein  50.15 
 
 		 362 aa  362  4e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3720  hypothetical protein  49.57 
 
 		 346 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.588173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3546  hypothetical protein  49.86 
 
 		 346 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279975  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4194  hypothetical protein  49.28 
 
 		 346 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0410  hypothetical protein  49.57 
 
 		 346 aa  354  2e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0511  hypothetical protein  50.57 
 
 		 346 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3367  hypothetical protein  49.42 
 
 		 350 aa  345  8e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0480  hypothetical protein  49.57 
 
 		 349 aa  344  1e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0424  hypothetical protein  49.57 
 
 		 346 aa  342  4e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3890  hypothetical protein  49.57 
 
 		 346 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877982  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0436  hypothetical protein  49.28 
 
 		 346 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.574558  hitchhiker  0.00210413 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0450  hypothetical protein  49.57 
 
 		 346 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3787  hypothetical protein  49.13 
 
 		 351 aa  340  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3197  hypothetical protein  48.41 
 
 		 346 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00822  hypothetical protein  49.71 
 
 		 348 aa  335  5e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0466  hypothetical protein  46.65 
 
 		 351 aa  330  2e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001652  glycosyltransferase  49.42 
 
 		 348 aa  327  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0533  hypothetical protein  48.28 
 
 		 350 aa  327  3e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1656  hypothetical protein  44.83 
 
 		 360 aa  310  2.9999999999999997e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00119867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2984  hypothetical protein  44.02 
 
 		 354 aa  296  5e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3289  hypothetical protein  42.37 
 
 		 366 aa  289  5.0000000000000004e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.60491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1492  hypothetical protein  41.94 
 
 		 347 aa  280  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286308  normal  0.0796091 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1681  hypothetical protein  39.77 
 
 		 347 aa  276  5e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0795  hypothetical protein  40.06 
 
 		 345 aa  275  6e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0695397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0454  hypothetical protein  38.12 
 
 		 343 aa  268  8e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0548  hypothetical protein  37.54 
 
 		 343 aa  264  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0675  hypothetical protein  37.79 
 
 		 343 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.575182  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1414  hypothetical protein  36.66 
 
 		 343 aa  255  8e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2218  hypothetical protein  38.6 
 
 		 347 aa  253  5.000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4031  hypothetical protein  33.53 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.510364  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3812  glycosyltransferase-distantly-related protein  33.24 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2842  UDP-glucuronosyltransferase-like protein  28.7 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0336  teichoic acid biosynthesis related protein  26.98 
 
 		 355 aa  93.6  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0254  teichoic acid biosynthesis related protein  25.07 
 
 		 367 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0266168  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0243  teichoic acid biosynthesis related protein  24.78 
 
 		 367 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0449  Glycosyltransferase 28 domain protein  25.55 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0253  teichoic acid biosynthesis related protein  26.32 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2563  UDP- glucuronosyltransferase-like glycosyl transferase  26.27 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504516  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0232  teichoic acid biosynthesis related protein  24.34 
 
 		 367 aa  82.8  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422227  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1235  teichoic acid biosynthesis related protein  25.61 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2254  teichoic acid biosynthesis related protein  25.32 
 
 		 381 aa  79.3  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.060696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6653  putative UDP-glucuronosyltransferase  27.42 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.109077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3660  putative glycosyltransferase  21.56 
 
 		 373 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359283  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1851  hypothetical protein  26.03 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.316148  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2719  teichoic acid biosynthesis related protein  23.64 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.194172  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5656  hypothetical protein  22.09 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1401  glycosyltransferase family 28 protein  24.01 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5685  Glycosyl transferase-like protein UDP- glucuronosyltransferase  21.74 
 
 		 382 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1235  glycosyltransferase family 28 protein  23.96 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110659  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0507  glycosyltransferase family 28 protein  22.84 
 
 		 361 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1391  glycosyltransferase family 28 protein  28.57 
 
 		 361 aa  50.1  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3193  hypothetical protein  20.67 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321046  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0820  glycosyltransferase family 28 protein  22.68 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.601054  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2159  glycosyltransferase family 28 protein  25.93 
 
 		 377 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.188732  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>