55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2563 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2563  UDP- glucuronosyltransferase-like glycosyl transferase  100 
 
 
371 aa  743    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3660  putative glycosyltransferase  46.38 
 
 
373 aa  335  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359283  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5685  Glycosyl transferase-like protein UDP- glucuronosyltransferase  42.9 
 
 
382 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2842  UDP-glucuronosyltransferase-like protein  29.06 
 
 
371 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0336  teichoic acid biosynthesis related protein  27.78 
 
 
355 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0449  Glycosyltransferase 28 domain protein  31.09 
 
 
377 aa  106  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1235  teichoic acid biosynthesis related protein  25.74 
 
 
360 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2719  teichoic acid biosynthesis related protein  28.57 
 
 
388 aa  88.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.194172  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0454  hypothetical protein  25.99 
 
 
343 aa  87.8  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6653  putative UDP-glucuronosyltransferase  27.51 
 
 
359 aa  86.7  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.109077 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0548  hypothetical protein  25.59 
 
 
343 aa  86.7  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2254  teichoic acid biosynthesis related protein  25.74 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.060696  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3812  glycosyltransferase-distantly-related protein  25.55 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0675  hypothetical protein  26.58 
 
 
343 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.575182  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0253  teichoic acid biosynthesis related protein  27.32 
 
 
366 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4072  hypothetical protein  26.27 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2062  hypothetical protein  29.05 
 
 
362 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1681  hypothetical protein  28.61 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0795  hypothetical protein  25.38 
 
 
345 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0695397  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1414  hypothetical protein  26.23 
 
 
343 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1851  hypothetical protein  26.06 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.316148  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4031  hypothetical protein  23.58 
 
 
328 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.510364  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4194  hypothetical protein  26.48 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0436  hypothetical protein  26.86 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.574558  hitchhiker  0.00210413 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3546  hypothetical protein  25.6 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279975  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0450  hypothetical protein  26.54 
 
 
346 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0424  hypothetical protein  26.54 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3720  hypothetical protein  25.6 
 
 
346 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.588173  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0410  hypothetical protein  25.6 
 
 
346 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2218  hypothetical protein  25.74 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3890  hypothetical protein  26.21 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877982  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3197  hypothetical protein  26.12 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3289  hypothetical protein  24.22 
 
 
366 aa  70.1  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.60491  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0254  teichoic acid biosynthesis related protein  24.33 
 
 
367 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0266168  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0511  hypothetical protein  26.75 
 
 
346 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1492  hypothetical protein  21.05 
 
 
347 aa  68.9  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286308  normal  0.0796091 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1656  hypothetical protein  23.84 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00119867  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0243  teichoic acid biosynthesis related protein  24.33 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0232  teichoic acid biosynthesis related protein  23.59 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422227  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0466  hypothetical protein  26.63 
 
 
351 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0533  hypothetical protein  24.93 
 
 
350 aa  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3367  hypothetical protein  24.29 
 
 
350 aa  65.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3787  hypothetical protein  25.62 
 
 
351 aa  65.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001652  glycosyltransferase  25.57 
 
 
348 aa  63.9  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2984  hypothetical protein  25.07 
 
 
354 aa  63.2  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00822  hypothetical protein  25.14 
 
 
348 aa  62  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0480  hypothetical protein  23.91 
 
 
349 aa  60.8  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2159  glycosyltransferase family 28 protein  24.64 
 
 
377 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.188732  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0507  glycosyltransferase family 28 protein  22.12 
 
 
361 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3193  hypothetical protein  27.94 
 
 
337 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321046  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1235  glycosyltransferase family 28 protein  22 
 
 
361 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110659  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00208  glycosyl transferase  23.83 
 
 
349 aa  49.7  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1401  glycosyltransferase family 28 protein  21.71 
 
 
361 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2407  glycosyltransferase  21.35 
 
 
383 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.245126  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0692  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  32.63 
 
 
339 aa  42.7  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>