56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001652 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_001652  glycosyltransferase  100 
 
 
348 aa  723    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00822  hypothetical protein  85.06 
 
 
348 aa  610  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2062  hypothetical protein  66.57 
 
 
362 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3367  hypothetical protein  52.34 
 
 
350 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0480  hypothetical protein  52.63 
 
 
349 aa  361  8e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3546  hypothetical protein  50.29 
 
 
346 aa  358  8e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279975  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0410  hypothetical protein  50.29 
 
 
346 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3720  hypothetical protein  50.29 
 
 
346 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.588173  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4072  hypothetical protein  49.42 
 
 
358 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4194  hypothetical protein  50.58 
 
 
346 aa  354  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3197  hypothetical protein  50.88 
 
 
346 aa  354  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3787  hypothetical protein  51.6 
 
 
351 aa  353  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0436  hypothetical protein  51.46 
 
 
346 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.574558  hitchhiker  0.00210413 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0450  hypothetical protein  51.46 
 
 
346 aa  351  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0424  hypothetical protein  51.17 
 
 
346 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3890  hypothetical protein  51.17 
 
 
346 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877982  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0511  hypothetical protein  49.42 
 
 
346 aa  348  6e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0533  hypothetical protein  49.42 
 
 
350 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0466  hypothetical protein  47.95 
 
 
351 aa  341  1e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1656  hypothetical protein  48.55 
 
 
360 aa  333  2e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00119867  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2984  hypothetical protein  47.37 
 
 
354 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00208  glycosyl transferase  49.11 
 
 
349 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1492  hypothetical protein  45.51 
 
 
347 aa  311  7.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286308  normal  0.0796091 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3289  hypothetical protein  43.53 
 
 
366 aa  300  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.60491  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0795  hypothetical protein  42.35 
 
 
345 aa  292  6e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0695397  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1681  hypothetical protein  39.41 
 
 
347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1414  hypothetical protein  41.18 
 
 
343 aa  280  3e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0454  hypothetical protein  38.42 
 
 
343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0548  hypothetical protein  39.59 
 
 
343 aa  269  4e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2218  hypothetical protein  40.35 
 
 
347 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0675  hypothetical protein  38.78 
 
 
343 aa  266  5.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.575182  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4031  hypothetical protein  35.45 
 
 
328 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.510364  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3812  glycosyltransferase-distantly-related protein  33.13 
 
 
346 aa  178  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6653  putative UDP-glucuronosyltransferase  28.85 
 
 
359 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.109077 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2842  UDP-glucuronosyltransferase-like protein  27.02 
 
 
371 aa  89  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0449  Glycosyltransferase 28 domain protein  28.44 
 
 
377 aa  87  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0232  teichoic acid biosynthesis related protein  26.7 
 
 
367 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422227  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1851  hypothetical protein  24.84 
 
 
359 aa  85.1  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.316148  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0253  teichoic acid biosynthesis related protein  27.27 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2563  UDP- glucuronosyltransferase-like glycosyl transferase  25.85 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504516  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0243  teichoic acid biosynthesis related protein  26.43 
 
 
367 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0254  teichoic acid biosynthesis related protein  26.16 
 
 
367 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0266168  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1235  teichoic acid biosynthesis related protein  24.03 
 
 
360 aa  73.6  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2719  teichoic acid biosynthesis related protein  25.31 
 
 
388 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.194172  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1401  glycosyltransferase family 28 protein  22.78 
 
 
361 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1235  glycosyltransferase family 28 protein  22.44 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110659  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2254  teichoic acid biosynthesis related protein  23.51 
 
 
381 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.060696  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0336  teichoic acid biosynthesis related protein  26.88 
 
 
355 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0507  glycosyltransferase family 28 protein  21.67 
 
 
361 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3660  putative glycosyltransferase  22 
 
 
373 aa  59.7  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359283  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1391  glycosyltransferase family 28 protein  24.92 
 
 
361 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5685  Glycosyl transferase-like protein UDP- glucuronosyltransferase  21.32 
 
 
382 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3193  hypothetical protein  22.19 
 
 
337 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321046  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2159  glycosyltransferase family 28 protein  23.36 
 
 
377 aa  50.8  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.188732  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0820  glycosyltransferase family 28 protein  21.33 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.601054  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5656  hypothetical protein  21.89 
 
 
364 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.512867 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>