56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00822 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00822  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  726    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001652  glycosyltransferase  85.06 
 
 
348 aa  605  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2062  hypothetical protein  64.83 
 
 
362 aa  486  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3367  hypothetical protein  50.58 
 
 
350 aa  363  3e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4072  hypothetical protein  49.71 
 
 
358 aa  358  7e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0480  hypothetical protein  51.46 
 
 
349 aa  358  7e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3197  hypothetical protein  49.71 
 
 
346 aa  354  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3546  hypothetical protein  48.54 
 
 
346 aa  350  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279975  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0410  hypothetical protein  48.54 
 
 
346 aa  349  3e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4194  hypothetical protein  49.12 
 
 
346 aa  349  4e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3787  hypothetical protein  49.85 
 
 
351 aa  348  6e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3720  hypothetical protein  48.54 
 
 
346 aa  348  7e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.588173  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0450  hypothetical protein  49.71 
 
 
346 aa  348  8e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0424  hypothetical protein  49.42 
 
 
346 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3890  hypothetical protein  49.42 
 
 
346 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877982  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0436  hypothetical protein  49.12 
 
 
346 aa  345  4e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.574558  hitchhiker  0.00210413 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0511  hypothetical protein  48.25 
 
 
346 aa  343  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1656  hypothetical protein  49.13 
 
 
360 aa  343  2e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00119867  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0466  hypothetical protein  47.66 
 
 
351 aa  341  1e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0533  hypothetical protein  48.54 
 
 
350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2984  hypothetical protein  47.37 
 
 
354 aa  323  4e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00208  glycosyl transferase  47.92 
 
 
349 aa  315  5e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1492  hypothetical protein  43.7 
 
 
347 aa  305  8.000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286308  normal  0.0796091 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3289  hypothetical protein  42.94 
 
 
366 aa  301  9e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.60491  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0795  hypothetical protein  41.76 
 
 
345 aa  287  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0695397  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1681  hypothetical protein  40.29 
 
 
347 aa  282  6.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0548  hypothetical protein  39.59 
 
 
343 aa  271  1e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1414  hypothetical protein  39.41 
 
 
343 aa  271  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2218  hypothetical protein  40 
 
 
347 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0675  hypothetical protein  39.36 
 
 
343 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.575182  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0454  hypothetical protein  37.83 
 
 
343 aa  267  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4031  hypothetical protein  33.54 
 
 
328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.510364  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3812  glycosyltransferase-distantly-related protein  33.33 
 
 
346 aa  177  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0232  teichoic acid biosynthesis related protein  25.95 
 
 
367 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422227  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2842  UDP-glucuronosyltransferase-like protein  27.45 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0243  teichoic acid biosynthesis related protein  25.68 
 
 
367 aa  89.4  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0254  teichoic acid biosynthesis related protein  25.95 
 
 
367 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0266168  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0449  Glycosyltransferase 28 domain protein  26.27 
 
 
377 aa  86.3  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0253  teichoic acid biosynthesis related protein  26.65 
 
 
366 aa  82.8  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6653  putative UDP-glucuronosyltransferase  26.35 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.109077 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2563  UDP- glucuronosyltransferase-like glycosyl transferase  25.14 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504516  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1851  hypothetical protein  24.35 
 
 
359 aa  75.9  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.316148  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0336  teichoic acid biosynthesis related protein  27.33 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1401  glycosyltransferase family 28 protein  25.14 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1235  teichoic acid biosynthesis related protein  26.03 
 
 
360 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2719  teichoic acid biosynthesis related protein  24.92 
 
 
388 aa  69.7  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.194172  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1235  glycosyltransferase family 28 protein  24.37 
 
 
361 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110659  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2254  teichoic acid biosynthesis related protein  23.22 
 
 
381 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.060696  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0507  glycosyltransferase family 28 protein  24.79 
 
 
361 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1391  glycosyltransferase family 28 protein  25.55 
 
 
361 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2159  glycosyltransferase family 28 protein  24.36 
 
 
377 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.188732  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3660  putative glycosyltransferase  20.34 
 
 
373 aa  57.4  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359283  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5685  Glycosyl transferase-like protein UDP- glucuronosyltransferase  20.66 
 
 
382 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3193  hypothetical protein  21.37 
 
 
337 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321046  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5656  hypothetical protein  22.78 
 
 
364 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2407  glycosyltransferase  31.71 
 
 
383 aa  43.9  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.245126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>