54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1656 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1656  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  748    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00119867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2984  hypothetical protein  51.46 
 
 		 354 aa  358  8e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3289  hypothetical protein  48.39 
 
 		 366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.60491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3720  hypothetical protein  49.14 
 
 		 346 aa  343  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.588173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3546  hypothetical protein  49.29 
 
 		 346 aa  343  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0410  hypothetical protein  49.01 
 
 		 346 aa  342  7e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4194  hypothetical protein  49.43 
 
 		 346 aa  341  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0511  hypothetical protein  48.99 
 
 		 346 aa  334  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0424  hypothetical protein  48.71 
 
 		 346 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3890  hypothetical protein  48.71 
 
 		 346 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877982  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0450  hypothetical protein  48.42 
 
 		 346 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3197  hypothetical protein  46.31 
 
 		 346 aa  331  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0436  hypothetical protein  48.14 
 
 		 346 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.574558  hitchhiker  0.00210413 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0466  hypothetical protein  47.84 
 
 		 351 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3787  hypothetical protein  48.56 
 
 		 351 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3367  hypothetical protein  46.13 
 
 		 350 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0480  hypothetical protein  46.29 
 
 		 349 aa  324  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00822  hypothetical protein  49.13 
 
 		 348 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0533  hypothetical protein  47.7 
 
 		 350 aa  319  5e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2062  hypothetical protein  45.63 
 
 		 362 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4072  hypothetical protein  44.83 
 
 		 358 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001652  glycosyltransferase  48.55 
 
 		 348 aa  308  6.999999999999999e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0454  hypothetical protein  42.99 
 
 		 343 aa  305  7e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0795  hypothetical protein  44.64 
 
 		 345 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0695397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0548  hypothetical protein  44.02 
 
 		 343 aa  302  8.000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1492  hypothetical protein  44.77 
 
 		 347 aa  299  4e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286308  normal  0.0796091 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1414  hypothetical protein  43.67 
 
 		 343 aa  295  1e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1681  hypothetical protein  41.67 
 
 		 347 aa  294  2e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0675  hypothetical protein  42.61 
 
 		 343 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.575182  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00208  glycosyl transferase  42.06 
 
 		 349 aa  276  5e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2218  hypothetical protein  42.4 
 
 		 347 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3812  glycosyltransferase-distantly-related protein  33.52 
 
 		 346 aa  176  4e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4031  hypothetical protein  31.37 
 
 		 328 aa  149  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.510364  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2842  UDP-glucuronosyltransferase-like protein  28.24 
 
 		 371 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0449  Glycosyltransferase 28 domain protein  30.16 
 
 		 377 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0336  teichoic acid biosynthesis related protein  29.38 
 
 		 355 aa  100  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0254  teichoic acid biosynthesis related protein  25.5 
 
 		 367 aa  92.8  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0266168  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0243  teichoic acid biosynthesis related protein  25.14 
 
 		 367 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2254  teichoic acid biosynthesis related protein  27.53 
 
 		 381 aa  89.7  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.060696  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1851  hypothetical protein  28.88 
 
 		 359 aa  89.4  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.316148  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0232  teichoic acid biosynthesis related protein  24.57 
 
 		 367 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422227  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6653  putative UDP-glucuronosyltransferase  27.38 
 
 		 359 aa  87.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.109077 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1235  teichoic acid biosynthesis related protein  26.34 
 
 		 360 aa  87  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0253  teichoic acid biosynthesis related protein  23.43 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2719  teichoic acid biosynthesis related protein  25.56 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.194172  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2563  UDP- glucuronosyltransferase-like glycosyl transferase  23.84 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504516  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1391  glycosyltransferase family 28 protein  23.71 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3660  putative glycosyltransferase  23.61 
 
 		 373 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359283  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3193  hypothetical protein  22.47 
 
 		 337 aa  57  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321046  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1401  glycosyltransferase family 28 protein  23.61 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0507  glycosyltransferase family 28 protein  23.05 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1235  glycosyltransferase family 28 protein  23.89 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110659  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0820  glycosyltransferase family 28 protein  21.45 
 
 		 359 aa  44.3  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.601054  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2009  glycosyltransferase  27.78 
 
 		 380 aa  43.1  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0518104  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>