53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3812 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3812  glycosyltransferase-distantly-related protein  100 
 
 
346 aa  720    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4031  hypothetical protein  49.24 
 
 
328 aa  345  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.510364  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3289  hypothetical protein  33.54 
 
 
366 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.60491  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2062  hypothetical protein  34.48 
 
 
362 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1656  hypothetical protein  33.52 
 
 
360 aa  176  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00119867  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4072  hypothetical protein  33.24 
 
 
358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3367  hypothetical protein  33.94 
 
 
350 aa  166  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3197  hypothetical protein  33.23 
 
 
346 aa  166  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2984  hypothetical protein  32.72 
 
 
354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0480  hypothetical protein  35.26 
 
 
349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4194  hypothetical protein  34.15 
 
 
346 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3720  hypothetical protein  33.14 
 
 
346 aa  160  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.588173  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0450  hypothetical protein  33.94 
 
 
346 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00822  hypothetical protein  33.33 
 
 
348 aa  159  9e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3546  hypothetical protein  32.72 
 
 
346 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279975  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0454  hypothetical protein  31.23 
 
 
343 aa  158  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0410  hypothetical protein  32.72 
 
 
346 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001652  glycosyltransferase  33.13 
 
 
348 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0533  hypothetical protein  34.34 
 
 
350 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3787  hypothetical protein  32.04 
 
 
351 aa  156  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0548  hypothetical protein  31.23 
 
 
343 aa  156  6e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0466  hypothetical protein  32.82 
 
 
351 aa  155  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3890  hypothetical protein  33.33 
 
 
346 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877982  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0424  hypothetical protein  33.33 
 
 
346 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0436  hypothetical protein  33.33 
 
 
346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.574558  hitchhiker  0.00210413 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0795  hypothetical protein  30.42 
 
 
345 aa  153  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0695397  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0511  hypothetical protein  32.42 
 
 
346 aa  152  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2218  hypothetical protein  31.23 
 
 
347 aa  151  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1414  hypothetical protein  29.91 
 
 
343 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00208  glycosyl transferase  32.72 
 
 
349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0675  hypothetical protein  29.82 
 
 
343 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.575182  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1681  hypothetical protein  30.55 
 
 
347 aa  144  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1492  hypothetical protein  30.68 
 
 
347 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286308  normal  0.0796091 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1851  hypothetical protein  26.35 
 
 
359 aa  103  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.316148  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2842  UDP-glucuronosyltransferase-like protein  27.57 
 
 
371 aa  86.7  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0254  teichoic acid biosynthesis related protein  27.27 
 
 
367 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0266168  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2563  UDP- glucuronosyltransferase-like glycosyl transferase  25.55 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504516  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0243  teichoic acid biosynthesis related protein  26.95 
 
 
367 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0232  teichoic acid biosynthesis related protein  26.3 
 
 
367 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422227  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1235  teichoic acid biosynthesis related protein  25.73 
 
 
360 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0253  teichoic acid biosynthesis related protein  24.92 
 
 
366 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0449  Glycosyltransferase 28 domain protein  24.84 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0336  teichoic acid biosynthesis related protein  24.75 
 
 
355 aa  72.8  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3660  putative glycosyltransferase  20.83 
 
 
373 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359283  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6653  putative UDP-glucuronosyltransferase  24.76 
 
 
359 aa  66.2  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.109077 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5685  Glycosyl transferase-like protein UDP- glucuronosyltransferase  23.53 
 
 
382 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1391  glycosyltransferase family 28 protein  23.4 
 
 
361 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2719  teichoic acid biosynthesis related protein  25.47 
 
 
388 aa  59.7  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.194172  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5656  hypothetical protein  24.92 
 
 
364 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2254  teichoic acid biosynthesis related protein  22.96 
 
 
381 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.060696  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0507  glycosyltransferase family 28 protein  21.74 
 
 
361 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1401  glycosyltransferase family 28 protein  21.47 
 
 
361 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1235  glycosyltransferase family 28 protein  21.73 
 
 
361 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>