55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3289 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3289  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  767    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.60491  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1656  hypothetical protein  48.39 
 
 
360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00119867  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0533  hypothetical protein  45.29 
 
 
350 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3367  hypothetical protein  45 
 
 
350 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3197  hypothetical protein  43.24 
 
 
346 aa  301  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3546  hypothetical protein  42.35 
 
 
346 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279975  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3720  hypothetical protein  42.35 
 
 
346 aa  300  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.588173  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3787  hypothetical protein  43.7 
 
 
351 aa  301  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4194  hypothetical protein  42.06 
 
 
346 aa  300  4e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0410  hypothetical protein  42.35 
 
 
346 aa  299  4e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0466  hypothetical protein  42.23 
 
 
351 aa  298  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0436  hypothetical protein  43.24 
 
 
346 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.574558  hitchhiker  0.00210413 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2984  hypothetical protein  41.62 
 
 
354 aa  298  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0450  hypothetical protein  42.94 
 
 
346 aa  296  5e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3890  hypothetical protein  42.65 
 
 
346 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877982  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0424  hypothetical protein  42.65 
 
 
346 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2062  hypothetical protein  42.06 
 
 
362 aa  292  5e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00208  glycosyl transferase  44.74 
 
 
349 aa  291  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0511  hypothetical protein  42.65 
 
 
346 aa  290  4e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4072  hypothetical protein  42.37 
 
 
358 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0480  hypothetical protein  42.4 
 
 
349 aa  288  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0454  hypothetical protein  41.06 
 
 
343 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00822  hypothetical protein  43.07 
 
 
348 aa  281  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0795  hypothetical protein  41.59 
 
 
345 aa  280  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0695397  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001652  glycosyltransferase  43.53 
 
 
348 aa  276  5e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1681  hypothetical protein  40.12 
 
 
347 aa  274  1.0000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0548  hypothetical protein  40.06 
 
 
343 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1492  hypothetical protein  40.7 
 
 
347 aa  270  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286308  normal  0.0796091 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0675  hypothetical protein  38.71 
 
 
343 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.575182  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1414  hypothetical protein  39.94 
 
 
343 aa  259  4e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2218  hypothetical protein  39.53 
 
 
347 aa  257  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3812  glycosyltransferase-distantly-related protein  33.54 
 
 
346 aa  187  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4031  hypothetical protein  34.05 
 
 
328 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.510364  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2842  UDP-glucuronosyltransferase-like protein  30.9 
 
 
371 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0449  Glycosyltransferase 28 domain protein  30.82 
 
 
377 aa  95.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1235  teichoic acid biosynthesis related protein  26.96 
 
 
360 aa  92.8  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1851  hypothetical protein  27.15 
 
 
359 aa  89.4  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.316148  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2719  teichoic acid biosynthesis related protein  26.37 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.194172  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6653  putative UDP-glucuronosyltransferase  27.16 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.109077 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0336  teichoic acid biosynthesis related protein  25.96 
 
 
355 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0232  teichoic acid biosynthesis related protein  26.23 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422227  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2254  teichoic acid biosynthesis related protein  27.78 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.060696  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0243  teichoic acid biosynthesis related protein  25.95 
 
 
367 aa  79.3  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0254  teichoic acid biosynthesis related protein  25.68 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0266168  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0253  teichoic acid biosynthesis related protein  26.1 
 
 
366 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2563  UDP- glucuronosyltransferase-like glycosyl transferase  24.22 
 
 
371 aa  70.1  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3660  putative glycosyltransferase  23.29 
 
 
373 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359283  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1391  glycosyltransferase family 28 protein  22.84 
 
 
361 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3193  hypothetical protein  25.23 
 
 
337 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321046  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0507  glycosyltransferase family 28 protein  21.14 
 
 
361 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5685  Glycosyl transferase-like protein UDP- glucuronosyltransferase  22.38 
 
 
382 aa  53.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1235  glycosyltransferase family 28 protein  21.58 
 
 
361 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110659  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1401  glycosyltransferase family 28 protein  22.07 
 
 
361 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0820  glycosyltransferase family 28 protein  21.97 
 
 
359 aa  43.9  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.601054  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2009  glycosyltransferase  22.63 
 
 
380 aa  43.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0518104  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>