70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3147 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3147  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 
204 aa  371  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587348  hitchhiker  0.00464713 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19600  hypothetical protein  66.67 
 
 
209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1725  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.52 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5536  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  31.22 
 
 
205 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1277  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.76 
 
 
201 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.184378 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1252  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.76 
 
 
201 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2882  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.58 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156757  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1374  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.19 
 
 
201 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0055276  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1352  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.19 
 
 
201 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.642809  normal  0.111178 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0892  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.19 
 
 
201 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4519  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.6 
 
 
228 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0424052  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.59 
 
 
211 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3953  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.83 
 
 
246 aa  57  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.377906  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1355  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.29 
 
 
248 aa  57  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.71041  normal  0.214701 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1580  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.81 
 
 
201 aa  55.8  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12737  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4011  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.92 
 
 
209 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.49 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2879  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.38 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2777  phosphatidylglycerophosphate synthase  28.57 
 
 
201 aa  52.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.786395  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  30.94 
 
 
212 aa  52.4  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1498  CDP-diacylglycerol-inositol 3-phosphatidyltransferase  33.53 
 
 
177 aa  52  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.611071  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0605  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.88 
 
 
203 aa  51.6  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1362  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  30.73 
 
 
265 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.39 
 
 
205 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243953 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0065  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.31 
 
 
197 aa  51.2  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.364844  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0463  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.46 
 
 
165 aa  50.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.52 
 
 
230 aa  50.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0365  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.38 
 
 
213 aa  50.1  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.18 
 
 
216 aa  50.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.324783  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  32.35 
 
 
225 aa  50.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3084  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.71 
 
 
200 aa  49.7  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1287  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  27.71 
 
 
200 aa  49.7  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0130341  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3841  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.4 
 
 
205 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4177  hypothetical protein  34.19 
 
 
238 aa  48.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.717128  normal  0.427947 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3006  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  27.27 
 
 
198 aa  48.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171368  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.18 
 
 
216 aa  48.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25 
 
 
216 aa  48.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5154  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.15 
 
 
301 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113865  decreased coverage  0.000103616 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3513  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.81 
 
 
201 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0430214  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.85 
 
 
200 aa  47  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2359  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.26 
 
 
201 aa  47  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.94 
 
 
200 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1524  hypothetical protein  27.23 
 
 
252 aa  46.6  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0010  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.67 
 
 
201 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1623  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  26.25 
 
 
201 aa  46.2  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2092  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.48 
 
 
215 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2283  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  28.44 
 
 
222 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802523  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2041  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40 
 
 
209 aa  45.1  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000224281 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2244  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  28.44 
 
 
222 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2291  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  28.44 
 
 
222 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0310  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.81 
 
 
204 aa  43.9  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2315  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  37.78 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0444691  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31700  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.56 
 
 
211 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2696  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.56 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
200 aa  43.5  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2560  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.82 
 
 
223 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2011  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  26.25 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.326145  normal  0.231246 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2289  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.85 
 
 
235 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2209  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25 
 
 
202 aa  43.1  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3836  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.05 
 
 
220 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10690  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  38.95 
 
 
203 aa  42.4  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0112608  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2373  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.86 
 
 
202 aa  42.4  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.486813  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3660  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.81 
 
 
205 aa  42.4  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2074  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.83 
 
 
202 aa  42.4  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.922495  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6126  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  34.91 
 
 
205 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.863904 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3037  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.24 
 
 
299 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2943  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.24 
 
 
299 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.382909  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2725  hypothetical protein  30.15 
 
 
264 aa  41.6  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0118  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.96 
 
 
209 aa  41.2  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1228  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.14 
 
 
200 aa  41.6  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>