155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1654 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1654  Radical SAM domain protein  100 
 
 
336 aa  695    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708396  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2148  pyruvate-formate lyase-activating enzyme-like protein  53.87 
 
 
330 aa  342  5e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3524  pyruvate-formate lyase-activating enzyme-like protein  52.47 
 
 
330 aa  342  7e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2865  radical SAM domain-containing protein  41.9 
 
 
331 aa  285  5e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1314  radical SAM domain-containing protein  34.86 
 
 
345 aa  205  1e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1123  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1095  radical SAM domain protein  33.33 
 
 
345 aa  196  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  31.58 
 
 
329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  31.58 
 
 
329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  31.47 
 
 
343 aa  162  8.000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2294  radical SAM family protein  32.59 
 
 
332 aa  153  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  29.38 
 
 
353 aa  152  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  31.9 
 
 
334 aa  149  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  29.76 
 
 
333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  31.21 
 
 
336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0464  Radical SAM domain protein  32.13 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.521225  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  30.5 
 
 
338 aa  146  5e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  28.96 
 
 
354 aa  145  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  30 
 
 
342 aa  145  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0325  Radical SAM domain protein  31.03 
 
 
333 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  28.83 
 
 
337 aa  142  8e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  31.27 
 
 
367 aa  142  9e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  28.99 
 
 
340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  29.57 
 
 
337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  28.96 
 
 
337 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 
333 aa  139  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  30.49 
 
 
336 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3292  Radical SAM domain protein  31.27 
 
 
366 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  27.05 
 
 
337 aa  137  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  29.79 
 
 
348 aa  137  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1325  radical SAM domain-containing protein  31.29 
 
 
365 aa  136  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.322233  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  29.76 
 
 
337 aa  136  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0904  Radical SAM domain protein  26.22 
 
 
395 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0776722 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  32.64 
 
 
286 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  28.27 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  27.84 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1728  hypothetical protein  28.27 
 
 
336 aa  134  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.241184  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1849  radical SAM family protein  27.02 
 
 
329 aa  134  3e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2430  radical SAM domain-containing protein  29.6 
 
 
365 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0451112 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2243  Radical SAM domain protein  29.59 
 
 
337 aa  133  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0396  radical SAM family protein  29.05 
 
 
358 aa  133  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  26.41 
 
 
344 aa  132  6e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2217  Radical SAM domain protein  29.97 
 
 
374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  27.25 
 
 
332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  28.57 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  29.48 
 
 
356 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0574  radical SAM domain protein  29.39 
 
 
361 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0728  Radical SAM domain protein  29.39 
 
 
361 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  29.18 
 
 
356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2948  radical SAM family Fe-S protein  25.75 
 
 
347 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1694  Radical SAM domain protein  32.24 
 
 
280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.953973 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1052  radical SAM family protein  27.99 
 
 
335 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  29.82 
 
 
337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  27.49 
 
 
362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  30.15 
 
 
366 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1005  radical SAM domain-containing protein  28.27 
 
 
370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  29.09 
 
 
339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  26.97 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0348  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 
336 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.224287  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  28.96 
 
 
364 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  28.53 
 
 
342 aa  126  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2293  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  29.09 
 
 
336 aa  126  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.388191  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1178  hypothetical protein  27.52 
 
 
358 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1969  radical SAM family protein  28 
 
 
370 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.327469 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1172  hypothetical protein  27.22 
 
 
358 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  28.27 
 
 
356 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1563  radical SAM domain-containing protein  24.63 
 
 
336 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.356418 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  24.62 
 
 
339 aa  124  3e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 
337 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1055  radical SAM domain-containing protein  24.68 
 
 
335 aa  123  4e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.146783  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1063  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 
336 aa  123  5e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.665632  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0898  radical SAM domain-containing protein  27.36 
 
 
369 aa  123  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2539  Radical SAM domain protein  30.79 
 
 
360 aa  122  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1058  radical SAM domain-containing protein  27.66 
 
 
382 aa  122  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1497  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 
365 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.398952  normal  0.0425103 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13159  pyruvate formate lyase activating protein pflA  29.1 
 
 
362 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0932  radical SAM domain-containing protein  27.66 
 
 
362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 
356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2681  Radical SAM domain protein  28.16 
 
 
314 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480916  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  27.57 
 
 
384 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6305  Radical SAM domain-containing protein  28.98 
 
 
388 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2431  radical SAM domain-containing protein  26.48 
 
 
396 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1064  radical SAM domain-containing protein  29.75 
 
 
364 aa  119  7e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  30.03 
 
 
360 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  27.3 
 
 
363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0073  pyruvate formate lyase-activating enzyme, putative  27.66 
 
 
365 aa  116  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  28.29 
 
 
282 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  26.57 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1841  Radical SAM domain protein  27.88 
 
 
340 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  26.89 
 
 
335 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1698  radical SAM domain-containing protein  24.53 
 
 
337 aa  114  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 
363 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0858  radical SAM domain-containing protein  29.52 
 
 
338 aa  112  6e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.844085 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0088  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 
357 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.400989  normal  0.227798 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0893  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 
361 aa  112  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.910266 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  25.69 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1870  radical SAM domain-containing protein  27.47 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6076  radical SAM family protein  27.63 
 
 
363 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  27.89 
 
 
351 aa  110  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0200  Radical SAM domain protein  29.69 
 
 
386 aa  109  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>