145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3524 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3524  pyruvate-formate lyase-activating enzyme-like protein  100 
 
 		 330 aa  675    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2148  pyruvate-formate lyase-activating enzyme-like protein  84.24 
 
 		 330 aa  546  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1654  Radical SAM domain protein  52.47 
 
 		 336 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2865  radical SAM domain-containing protein  43.64 
 
 		 331 aa  305  5.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1314  radical SAM domain-containing protein  35.03 
 
 		 345 aa  225  8e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1123  radical SAM domain-containing protein  35.63 
 
 		 345 aa  224  1e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1095  radical SAM domain protein  35.03 
 
 		 345 aa  224  2e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  29.36 
 
 		 329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  29.36 
 
 		 329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  30.82 
 
 		 333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  31.07 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  31.72 
 
 		 353 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  27.52 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  31.31 
 
 		 334 aa  150  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  29.57 
 
 		 340 aa  149  9e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  29.76 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  29.2 
 
 		 337 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  30.06 
 
 		 337 aa  146  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2293  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  28.88 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.388191  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  28.53 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  27.06 
 
 		 342 aa  142  7e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2243  Radical SAM domain protein  29.04 
 
 		 337 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  32.18 
 
 		 337 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0464  Radical SAM domain protein  29.67 
 
 		 348 aa  140  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.521225  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  27.25 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1728  hypothetical protein  28.1 
 
 		 336 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.241184  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1052  radical SAM family protein  30.18 
 
 		 335 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0325  Radical SAM domain protein  27.65 
 
 		 333 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  32.06 
 
 		 337 aa  139  7e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  29.81 
 
 		 336 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3292  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 366 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  32.62 
 
 		 366 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  31.25 
 
 		 348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2948  radical SAM family Fe-S protein  27.3 
 
 		 347 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  29.23 
 
 		 336 aa  136  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  26.87 
 
 		 354 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  27.79 
 
 		 344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  28.44 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2539  Radical SAM domain protein  30.67 
 
 		 360 aa  132  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  31.1 
 
 		 367 aa  132  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1849  radical SAM family protein  26.1 
 
 		 329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  26.82 
 
 		 362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2294  radical SAM family protein  29.94 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2430  radical SAM domain-containing protein  31.06 
 
 		 365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0451112 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  29.34 
 
 		 364 aa  130  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  28.1 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0396  radical SAM family protein  29.41 
 
 		 358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0348  radical SAM domain-containing protein  25.9 
 
 		 336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.224287  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  29.25 
 
 		 342 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  30.59 
 
 		 286 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  25.23 
 
 		 339 aa  129  7.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1563  radical SAM domain-containing protein  25.9 
 
 		 336 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.356418 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1841  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1325  radical SAM domain-containing protein  29.54 
 
 		 365 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.322233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  27.16 
 
 		 331 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0904  Radical SAM domain protein  24.55 
 
 		 395 aa  125  9e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0776722 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  27.16 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0932  radical SAM domain-containing protein  28.99 
 
 		 362 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  27.38 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1063  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 336 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.665632  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2431  radical SAM domain-containing protein  28.92 
 
 		 396 aa  124  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0574  radical SAM domain protein  28 
 
 		 361 aa  122  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0728  Radical SAM domain protein  28 
 
 		 361 aa  122  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  29.72 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  25.39 
 
 		 326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0073  pyruvate formate lyase-activating enzyme, putative  27.74 
 
 		 365 aa  120  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  26.44 
 
 		 343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  22.42 
 
 		 356 aa  119  6e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1055  radical SAM domain-containing protein  24.1 
 
 		 335 aa  119  9e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.146783  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1497  radical SAM domain-containing protein  26.77 
 
 		 365 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.398952  normal  0.0425103 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13159  pyruvate formate lyase activating protein pflA  29.05 
 
 		 362 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1058  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 		 382 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1969  radical SAM family protein  26.79 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.327469 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2217  Radical SAM domain protein  28.4 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2681  Radical SAM domain protein  25.71 
 
 		 314 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480916  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  29.72 
 
 		 356 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  26.41 
 
 		 384 aa  116  5e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  29.1 
 
 		 356 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  26.41 
 
 		 364 aa  115  7.999999999999999e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1698  radical SAM domain-containing protein  24.32 
 
 		 337 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  28.1 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0449  radical SAM family protein  29.69 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355453  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6305  Radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1172  hypothetical protein  26.44 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1178  hypothetical protein  26.92 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  24.93 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1870  radical SAM domain-containing protein  28.05 
 
 		 374 aa  114  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  27.06 
 
 		 363 aa  112  6e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 363 aa  112  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1005  radical SAM domain-containing protein  26.33 
 
 		 370 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  25.22 
 
 		 376 aa  112  7.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0858  radical SAM domain-containing protein  28.35 
 
 		 338 aa  112  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.844085 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2684  Radical SAM domain protein  27.91 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307935  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  25.42 
 
 		 282 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0898  radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 		 369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1694  Radical SAM domain protein  29.83 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.953973 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5878  Radical SAM domain protein  26.25 
 
 		 362 aa  109  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>