More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0330 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
326 aa  649    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.833436  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7251  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.81 
 
 
300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0872  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.95 
 
 
302 aa  195  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.96562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3171  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.94 
 
 
293 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5710  alcohol dehydrogenase  39.31 
 
 
324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5331  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.99 
 
 
324 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5420  alcohol dehydrogenase  38.99 
 
 
324 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4178  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.5 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.698619  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  35.67 
 
 
297 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7910  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.88 
 
 
302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.13 
 
 
305 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0288  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.91 
 
 
313 aa  136  5e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.817819  normal  0.0965437 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4105  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.22 
 
 
304 aa  135  9e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3480  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.86 
 
 
307 aa  132  6e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  normal  0.315176 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4331  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.06 
 
 
301 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  34.49 
 
 
307 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.051943  normal  0.176939 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4346  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.86 
 
 
306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0220735  normal  0.953349 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2217  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.94 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0510  alcohol dehydrogenase  33.54 
 
 
326 aa  123  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2563  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.52 
 
 
311 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111047  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0422  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.39 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0483327  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  30.75 
 
 
308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3597  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.18 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3524  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.88 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166573  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0914  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.06 
 
 
301 aa  117  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1951  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.02 
 
 
332 aa  115  7.999999999999999e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0066  alcohol dehydrogenase  32.59 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3546  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.52 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  30.31 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  33.54 
 
 
314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4637  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.44 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1237  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.93 
 
 
308 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1067  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.81 
 
 
309 aa  107  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2613  alcohol dehydrogenase  30.22 
 
 
316 aa  107  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  32.42 
 
 
314 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2644  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.21 
 
 
329 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3903  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.98 
 
 
314 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0434  alcohol dehydrogenase  29.83 
 
 
339 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  27.22 
 
 
313 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1925  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.05 
 
 
317 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000755536  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.27 
 
 
335 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1504  alcohol dehydrogenase  31.76 
 
 
333 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.139822  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4460  alcohol dehydrogenase  33.67 
 
 
319 aa  102  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.69 
 
 
317 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0886  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  32.62 
 
 
315 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.59 
 
 
314 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1020  quinone oxidoreductase  28.09 
 
 
315 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.740068  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0227  alcohol dehydrogenase  28.61 
 
 
349 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  27.54 
 
 
304 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0667  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.75 
 
 
314 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.518551  hitchhiker  0.00083815 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5087  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.74 
 
 
334 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2578  alcohol dehydrogenase  26.7 
 
 
352 aa  99.8  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711518  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01926  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35 
 
 
335 aa  100  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2124  alcohol dehydrogenase  29.79 
 
 
335 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185459  normal  0.116252 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  31.64 
 
 
305 aa  99.4  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2213  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.22 
 
 
310 aa  99  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2309  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.73 
 
 
309 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.89 
 
 
317 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1820  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.51 
 
 
305 aa  97.8  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.746691  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24500  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  34.48 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6236  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.32 
 
 
326 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547714  normal  0.621953 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.58 
 
 
326 aa  97.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6978  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4019  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.2 
 
 
317 aa  96.7  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.209092 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.07 
 
 
308 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2575  alcohol dehydrogenase  31.7 
 
 
332 aa  96.3  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  32.73 
 
 
584 aa  95.9  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0418  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.78 
 
 
327 aa  95.9  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2964  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  29.15 
 
 
337 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1489  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.18 
 
 
330 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151992  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1245  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  29.33 
 
 
338 aa  95.1  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490679  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4263  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.52 
 
 
342 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493971  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2218  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.32 
 
 
343 aa  94  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2461  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.4 
 
 
319 aa  94.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9339  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.89 
 
 
311 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130562  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  31.21 
 
 
336 aa  93.2  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  31.45 
 
 
322 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.24 
 
 
324 aa  93.2  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1156  quinone oxidoreductase  33.48 
 
 
389 aa  92.8  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40 
 
 
335 aa  92.8  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1547  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.54 
 
 
339 aa  92.4  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.135035  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1036  alcohol dehydrogenase  29 
 
 
333 aa  92.4  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.21 
 
 
311 aa  92.4  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2003  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  29.36 
 
 
335 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5695  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.92 
 
 
343 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  29.03 
 
 
3679 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0384  NADPH-quinone reductase  28.91 
 
 
339 aa  92  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1526  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  30.35 
 
 
313 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10198  ripening-induced protein-putative Zn-containing oxidoreductase  30.09 
 
 
329 aa  91.7  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.622763  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3507  alcohol dehydrogenase  29.65 
 
 
322 aa  92  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3581  response regulator receiver protein  29.25 
 
 
332 aa  92  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3737  alcohol dehydrogenase  29.39 
 
 
307 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1023  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3890  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.42 
 
 
337 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0091  alcohol dehydrogenase  29.46 
 
 
330 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  36.82 
 
 
331 aa  90.9  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6202  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.27 
 
 
328 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85677  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05420  Quinone oxidoreductase, putative  27 
 
 
358 aa  90.5  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1166  alcohol dehydrogenase  28.7 
 
 
333 aa  90.5  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5892  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.45 
 
 
310 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4732  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.55 
 
 
328 aa  89.7  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>