More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_24500 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_24500  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  100 
 
 
312 aa  587  1e-166  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0914  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.67 
 
 
301 aa  290  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0288  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.83 
 
 
313 aa  168  8e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.817819  normal  0.0965437 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1547  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.33 
 
 
339 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.135035  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  39.27 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.051943  normal  0.176939 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2217  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.26 
 
 
310 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0739832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7251  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.42 
 
 
300 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5710  alcohol dehydrogenase  38.8 
 
 
324 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7910  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5331  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 
324 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5420  alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 
324 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3171  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.86 
 
 
293 aa  146  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.97 
 
 
305 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0872  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.26 
 
 
302 aa  139  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.96562 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.37 
 
 
317 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2563  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.2 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111047  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.05 
 
 
317 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4346  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.49 
 
 
306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0220735  normal  0.953349 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4460  alcohol dehydrogenase  38.71 
 
 
319 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1166  alcohol dehydrogenase  33.94 
 
 
333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3597  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.24 
 
 
326 aa  129  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  32.65 
 
 
308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  32.24 
 
 
304 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3480  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.34 
 
 
307 aa  124  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  normal  0.315176 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.91 
 
 
322 aa  123  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  33.22 
 
 
305 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.57 
 
 
332 aa  122  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  36.71 
 
 
314 aa  122  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05420  Quinone oxidoreductase, putative  29.91 
 
 
358 aa  122  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.57 
 
 
332 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1036  alcohol dehydrogenase  33.03 
 
 
333 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4105  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.35 
 
 
304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0510  alcohol dehydrogenase  34.19 
 
 
326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.57 
 
 
332 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1237  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.13 
 
 
308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3438  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.47 
 
 
321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0066  alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 
309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.25 
 
 
332 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  35.44 
 
 
314 aa  119  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2461  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.99 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4766  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.6 
 
 
302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0781681  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2402  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.62 
 
 
334 aa  116  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.48 
 
 
326 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.833436  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1067  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.67 
 
 
309 aa  115  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1489  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.44 
 
 
330 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151992  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.53 
 
 
310 aa  115  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0667  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.67 
 
 
314 aa  115  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.518551  hitchhiker  0.00083815 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.62 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.62 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.62 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  27.62 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.62 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0692  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.91 
 
 
320 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
335 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1679  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1526  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  39.44 
 
 
313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  35.15 
 
 
297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.58 
 
 
639 aa  113  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2101  alcohol dehydrogenase  32.41 
 
 
353 aa  113  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01926  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.35 
 
 
335 aa  112  7.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1997  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.35 
 
 
341 aa  112  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  36.45 
 
 
325 aa  112  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2218  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.73 
 
 
343 aa  112  9e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1998  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.91 
 
 
318 aa  112  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751932  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3546  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.24 
 
 
315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.89 
 
 
323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0422  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.89 
 
 
334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0483327  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.75 
 
 
320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5892  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.25 
 
 
310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.07 
 
 
326 aa  109  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6978  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5739  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
308 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.382073  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0783  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.6 
 
 
347 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3337  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.94 
 
 
331 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.88 
 
 
326 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2124  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.23 
 
 
328 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.386337  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0948  NADPH:quinone reductase related Zn-dependent oxidoreductase  33.16 
 
 
312 aa  108  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.102607  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.43 
 
 
317 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4764  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  31.97 
 
 
324 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000104281  hitchhiker  0.000232398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5296  Beta-ketoacyl synthase  28.71 
 
 
5802 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0721794 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  28.43 
 
 
317 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3524  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.86 
 
 
323 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166573  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1925  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.74 
 
 
317 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000755536  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0506  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.8 
 
 
317 aa  106  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 
321 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4431  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.03 
 
 
352 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761355  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  32.7 
 
 
322 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4384  alcohol dehydrogenase  31.44 
 
 
333 aa  106  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  28.25 
 
 
308 aa  105  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0954  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.49 
 
 
330 aa  105  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.319163  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.58 
 
 
332 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7387  putative quinone oxidoreductase  30.94 
 
 
319 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  30.3 
 
 
337 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.74 
 
 
333 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  30.65 
 
 
312 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1584  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  32.57 
 
 
310 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.63 
 
 
343 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386855  normal  0.701371 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2123  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.64 
 
 
328 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2644  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.87 
 
 
329 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165353 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2613  alcohol dehydrogenase  30.59 
 
 
316 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.616835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>