More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4766 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4766  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
302 aa  576  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0781681  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4460  alcohol dehydrogenase  56.99 
 
 
319 aa  290  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2217  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51 
 
 
310 aa  246  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0739832  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3546  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.29 
 
 
315 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0667  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.48 
 
 
314 aa  168  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.518551  hitchhiker  0.00083815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.93 
 
 
305 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7251  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.18 
 
 
300 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  37.46 
 
 
307 aa  139  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.051943  normal  0.176939 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5331  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.33 
 
 
324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5420  alcohol dehydrogenase  37.33 
 
 
324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5710  alcohol dehydrogenase  37 
 
 
324 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7910  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.49 
 
 
302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0288  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.37 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.817819  normal  0.0965437 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4346  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.75 
 
 
306 aa  125  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0220735  normal  0.953349 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3597  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.35 
 
 
326 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0091  alcohol dehydrogenase  34.92 
 
 
330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.02 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3480  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.18 
 
 
307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  normal  0.315176 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.75 
 
 
335 aa  112  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.94 
 
 
345 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.17 
 
 
326 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00210  NADH-quinone oxidoreductase  31.73 
 
 
325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336084  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4431  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.67 
 
 
352 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761355  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1237  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.13 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2960  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.71 
 
 
367 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3171  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.76 
 
 
293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0914  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.19 
 
 
301 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2563  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.51 
 
 
311 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111047  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.73 
 
 
342 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.52 
 
 
342 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0872  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.59 
 
 
302 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.96562 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0261  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family  32.27 
 
 
324 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4105  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.32 
 
 
304 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0848  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.31 
 
 
343 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  36.49 
 
 
297 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.52 
 
 
342 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0948  NADPH:quinone reductase related Zn-dependent oxidoreductase  27.81 
 
 
312 aa  105  9e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.102607  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.19 
 
 
343 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386855  normal  0.701371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2820  alcohol dehydrogenase  30.94 
 
 
326 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.516166 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
322 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6197  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.79 
 
 
343 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  37.78 
 
 
308 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2677  alcohol dehydrogenase  30.94 
 
 
326 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0692  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.1 
 
 
320 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0066  alcohol dehydrogenase  32.67 
 
 
309 aa  103  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5285  NADPH-dependent quinone oxidoreductase  36.71 
 
 
326 aa  102  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24500  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  39.6 
 
 
312 aa  102  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0233  quinone oxidoreductase  34.97 
 
 
323 aa  102  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2124  alcohol dehydrogenase  31.65 
 
 
335 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185459  normal  0.116252 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1596  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.18 
 
 
326 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1951  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.47 
 
 
332 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1067  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33 
 
 
309 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3064  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.27 
 
 
367 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2359  alcohol dehydrogenase  29.79 
 
 
351 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.137767 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.63 
 
 
326 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0886  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  31.56 
 
 
315 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.61 
 
 
317 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1221  putative quinone oxidoreductase  35.37 
 
 
331 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.908544  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0935  putative quinone oxidoreductase  35.37 
 
 
331 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1920  putative quinone oxidoreductase  35.37 
 
 
323 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0232  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.37 
 
 
323 aa  99  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2197  putative quinone oxidoreductase  35.37 
 
 
323 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51788  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1683  quinone oxidoreductase, putative  35.37 
 
 
323 aa  99  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.31 
 
 
348 aa  99  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2827  alcohol dehydrogenase  37.9 
 
 
339 aa  99  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.582411  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  29.57 
 
 
313 aa  99  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3840  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.87 
 
 
323 aa  97.4  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00789848 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2042  quinone oxidoreductase  35.32 
 
 
327 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282793  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1350  quinone oxidoreductase  35.32 
 
 
327 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3099  putative quinone oxidoreductase  35.32 
 
 
327 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2332  quinone oxidoreductase  35.32 
 
 
327 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.51 
 
 
326 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1065  quinone oxidoreductase  35.32 
 
 
327 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  30.29 
 
 
324 aa  97.4  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0322  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.05 
 
 
331 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.08 
 
 
326 aa  97.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6978  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2101  alcohol dehydrogenase  34.29 
 
 
353 aa  97.1  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  30.41 
 
 
322 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  30.53 
 
 
328 aa  97.1  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1439  quinone oxidoreductase  34.86 
 
 
327 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.01 
 
 
314 aa  96.7  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.57 
 
 
323 aa  97.1  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7175  alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 
327 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.11 
 
 
323 aa  96.3  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  31.44 
 
 
321 aa  96.3  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2310  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  33.77 
 
 
310 aa  96.3  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  33.19 
 
 
324 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1585  alcohol dehydrogenase  31.49 
 
 
326 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  31.9 
 
 
336 aa  95.9  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  31.02 
 
 
327 aa  95.9  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.85 
 
 
327 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0021  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.39 
 
 
325 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00189953  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1833  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
328 aa  94.7  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.053429  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1821  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.22 
 
 
322 aa  95.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00168562  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11482  quinone reductase qor (NADPH:quinone reductase) (zeta-crystallin protein)  33.93 
 
 
328 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000201943  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  32.31 
 
 
327 aa  94.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.84 
 
 
317 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5739  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.71 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.382073  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1526  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  37.91 
 
 
313 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1679  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
318 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>