63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH03140 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006693  CNH03140  expressed protein  100 
 
 		 378 aa  782    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.238117  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00440  conserved hypothetical protein  43.9 
 
 		 375 aa  302  8.000000000000001e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00500  conserved hypothetical protein  44.88 
 
 		 381 aa  293  4e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45304  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01734  3-dehydroshikimate dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08740)  27.18 
 
 		 354 aa  95.1  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109139  normal  0.0225904 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02478  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G00240)  25.14 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2225  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  27.35 
 
 		 635 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44574  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01140  hypothetical protein similar to dehydroshikimate dehydratase (Eurofung)  26.14 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.518528 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4415  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  24.7 
 
 		 628 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4305  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  24.7 
 
 		 628 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.92924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3362  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.91 
 
 		 635 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.283519  normal  0.789434 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5035  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25.81 
 
 		 632 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5095  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  26.22 
 
 		 604 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3161  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.46 
 
 		 635 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.706766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0292  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  23.94 
 
 		 615 aa  75.5  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2554  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.46 
 
 		 635 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00914053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2346  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, putative  26.99 
 
 		 635 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4905  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  27.06 
 
 		 633 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2130  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.99 
 
 		 635 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0402618  normal  0.678263 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0418  xylose isomerase domain-containing protein  25.91 
 
 		 635 aa  73.6  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4496  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  23.72 
 
 		 638 aa  73.6  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0327  hypothetical protein  25.21 
 
 		 634 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.627098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03000  hypothetical protein  24.79 
 
 		 634 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135939 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4090  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.6 
 
 		 645 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00816269 
 
 
-
 
NC_003296  RS02058  hypothetical protein  23.91 
 
 		 626 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0224521  normal  0.842888 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1560  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  22.13 
 
 		 632 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.288895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0606  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  23.53 
 
 		 624 aa  66.6  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0633938 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1081  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  23.77 
 
 		 628 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796659  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5449  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  23.79 
 
 		 615 aa  66.2  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2375  xylose isomerase-like TIM barrel  26.19 
 
 		 477 aa  65.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4204  xylose isomerase domain-containing protein  23.53 
 
 		 629 aa  63.2  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2059  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, putative  24.71 
 
 		 687 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0782  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  20.91 
 
 		 630 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.817905  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6113  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  22.31 
 
 		 623 aa  60.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38100  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  27.88 
 
 		 632 aa  59.7  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.749235  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7092  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  22.02 
 
 		 631 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0122  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.91 
 
 		 627 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134725  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5952  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  21.15 
 
 		 631 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0955687  decreased coverage  0.00791612 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4079  xylose isomerase domain-containing protein  23.92 
 
 		 629 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4442  xylose isomerase domain-containing protein  23.96 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.481875  normal  0.31172 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0882  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  24.8 
 
 		 627 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3855  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.9 
 
 		 624 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4755  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  23.36 
 
 		 637 aa  57  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4428  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  21 
 
 		 633 aa  56.6  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4666  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  23.11 
 
 		 630 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.735725 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4567  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.1 
 
 		 627 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3418  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  23.11 
 
 		 630 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0242311  normal  0.14685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3320  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  23.84 
 
 		 630 aa  53.5  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1752  putative 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25.1 
 
 		 684 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10433  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5194  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  22.71 
 
 		 630 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0848  putative 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25.1 
 
 		 684 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2205  putative 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25.1 
 
 		 684 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1894  putative amino acid dioxygenase  25.1 
 
 		 684 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0891  AP endonuclease  25.1 
 
 		 684 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.940921  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0481  AP endonuclease  25.1 
 
 		 684 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0577  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25.48 
 
 		 687 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0343  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  22.12 
 
 		 630 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1854  xylose isomerase-like TIM barrel  22.58 
 
 		 297 aa  49.7  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.151277  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5305  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  22.22 
 
 		 630 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.114512 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3062  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  22.22 
 
 		 630 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4963  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  22.22 
 
 		 630 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0115166 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1586  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  33.93 
 
 		 621 aa  46.6  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435654  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1477  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.51 
 
 		 596 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1656  xylose isomerase domain-containing protein  21.2 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.876977 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>