27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0325 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0325  anthranilate synthase component I and chorismate binding protein  100 
 
 		 425 aa  849    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.453641  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1216  conserved hypothetical protein, putative ComEC/Rec2-related protein domain protein  44.05 
 
 		 418 aa  330  4e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.387702  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0421  ComEC/Rec2 family protein  42.78 
 
 		 403 aa  314  1.9999999999999998e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0761  ComEC/Rec2 family protein  38.14 
 
 		 419 aa  299  8e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0064683  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1345  ComEC/Rec2 family protein  42.57 
 
 		 419 aa  286  5e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1594  ComEC/Rec2-related protein  39.75 
 
 		 421 aa  236  6e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.872637  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0374  ComEC/Rec2-related protein  32.97 
 
 		 420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.22 
 
 		 837 aa  50.8  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.47 
 
 		 797 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  30.88 
 
 		 679 aa  48.9  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.34 
 
 		 757 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.73 
 
 		 734 aa  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07760  ComEC/Rec2-related protein  28.1 
 
 		 843 aa  48.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.121725  normal  0.611385 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1990  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.87 
 
 		 835 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.41 
 
 		 840 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  28.17 
 
 		 872 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2124  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.17 
 
 		 860 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118158  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1186  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.81 
 
 		 722 aa  44.7  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.41344  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2458  ComEC/Rec2-related protein  24.91 
 
 		 724 aa  44.3  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000361147  unclonable  0.000000000000145403 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.7 
 
 		 818 aa  44.3  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3836  ComEC/Rec2-related protein  25.36 
 
 		 769 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5470  ComEC/Rec2-related protein  22.38 
 
 		 819 aa  43.9  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0243  ComEC/Rec2-related protein  21.39 
 
 		 369 aa  43.9  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3188  ComEC/Rec2-related protein  21.76 
 
 		 519 aa  43.9  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3847  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.52 
 
 		 806 aa  43.5  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0450  hypothetical protein  25 
 
 		 706 aa  43.5  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.778093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  29.93 
 
 		 694 aa  43.5  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>