76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0374 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0374  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 
420 aa  829    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1594  ComEC/Rec2-related protein  34.84 
 
 
421 aa  204  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.872637  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1216  conserved hypothetical protein, putative ComEC/Rec2-related protein domain protein  35 
 
 
418 aa  186  6e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.387702  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0761  ComEC/Rec2 family protein  32.31 
 
 
419 aa  183  6e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0064683  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1345  ComEC/Rec2 family protein  36.03 
 
 
419 aa  182  7e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0421  ComEC/Rec2 family protein  33 
 
 
403 aa  179  8e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0325  anthranilate synthase component I and chorismate binding protein  31.7 
 
 
425 aa  167  4e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.453641  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  31.89 
 
 
694 aa  63.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1711  hypothetical protein  27.07 
 
 
737 aa  60.5  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0805358  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2973  competence protein  28.57 
 
 
626 aa  58.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.530414  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  25.07 
 
 
679 aa  56.6  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1609  ComEC/Rec2-related protein  25.3 
 
 
546 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  27.53 
 
 
825 aa  53.5  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1594  ComEC/Rec2-related protein  26.35 
 
 
511 aa  52  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.24 
 
 
752 aa  51.2  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.06 
 
 
761 aa  50.8  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2040  hypothetical protein  23.76 
 
 
763 aa  50.1  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1768  hypothetical protein  24.31 
 
 
763 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44185  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.68 
 
 
773 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0736  putative competence-related protein  28.57 
 
 
768 aa  49.3  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1722  ComEC/Rec2-related protein  24.38 
 
 
733 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.88 
 
 
773 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1186  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.18 
 
 
722 aa  48.5  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.41344  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.78 
 
 
780 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2124  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.55 
 
 
860 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118158  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07760  ComEC/Rec2-related protein  24.54 
 
 
843 aa  48.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.121725  normal  0.611385 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0350  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.31 
 
 
822 aa  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1551  ComEC/Rec2-related protein  26.15 
 
 
734 aa  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159101  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0785  competence protein, ComEC  28.89 
 
 
986 aa  48.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.83 
 
 
772 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.83 
 
 
773 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.83 
 
 
772 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.83 
 
 
654 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1656  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.26 
 
 
781 aa  47.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.754434  hitchhiker  0.00232522 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0791  ComEC/Rec2-related protein  28.24 
 
 
1006 aa  47.8  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.52274  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1519  ComEC/Rec2-related protein  25 
 
 
531 aa  47.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0429537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.03 
 
 
773 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1588  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  28.57 
 
 
760 aa  47  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  30.83 
 
 
773 aa  47  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1395  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.08 
 
 
799 aa  47.4  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.751306  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3433  ComEC/Rec2-related protein  26.09 
 
 
494 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.179393 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.91 
 
 
798 aa  46.6  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2209  hypothetical protein  24.22 
 
 
747 aa  46.6  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.785174  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0813  ComEC/Rec2-related protein  26.35 
 
 
591 aa  46.6  0.0009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.56111  hitchhiker  0.00293052 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0978  ComEC/Rec2-related protein  24.07 
 
 
722 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.134973 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0604  putative competence locus E  30.3 
 
 
416 aa  45.8  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.790814  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1270  ComEC/Rec2-related protein  31.1 
 
 
439 aa  46.2  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1070  ComEC/Rec2-related protein  24.74 
 
 
593 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1738  ComEC/Rec2-related protein  33.33 
 
 
1035 aa  46.2  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.93623  normal  0.347072 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.57 
 
 
773 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  24.53 
 
 
795 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.42 
 
 
818 aa  45.8  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.84 
 
 
757 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1990  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.88 
 
 
835 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.21 
 
 
796 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.45 
 
 
797 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1104  ComEC/Rec2-related protein  25.91 
 
 
448 aa  45.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00214234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.82 
 
 
773 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.7 
 
 
766 aa  44.7  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2310  hypothetical protein  24.84 
 
 
793 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.27 
 
 
734 aa  45.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1497  ComEC/Rec2-related protein  26.85 
 
 
728 aa  44.3  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.177997  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1320  ComEC/Rec2-related protein  30.23 
 
 
524 aa  44.3  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.725773  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.53 
 
 
795 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1074  hypothetical protein  22.7 
 
 
754 aa  44.3  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.361238  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0330  putative hydrolase  26.54 
 
 
474 aa  43.9  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2149  ComEC/Rec2-related protein  27.46 
 
 
644 aa  44.3  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.452162 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2101  ComEC/Rec2-related protein  27.75 
 
 
636 aa  44.3  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.639499  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1519  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.48 
 
 
790 aa  43.9  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2207  hypothetical protein  22.7 
 
 
754 aa  43.9  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.01066  normal  0.239269 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0804  ComEC/Rec2-related protein  24.89 
 
 
795 aa  43.5  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.569588  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00924  hypothetical protein  22.7 
 
 
754 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.630751  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00917  conserved inner membrane protein  22.7 
 
 
754 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.578469  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2683  hypothetical protein  22.7 
 
 
754 aa  43.5  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.692344  normal  0.226957 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2730  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.7 
 
 
754 aa  43.5  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170872  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0644  ComEC/Rec2-related protein  23.01 
 
 
700 aa  43.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.851772  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>