28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0421 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0421  ComEC/Rec2 family protein  100 
 
 		 403 aa  804    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0761  ComEC/Rec2 family protein  44.83 
 
 		 419 aa  332  1e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0064683  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1216  conserved hypothetical protein, putative ComEC/Rec2-related protein domain protein  41.19 
 
 		 418 aa  326  5e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.387702  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0325  anthranilate synthase component I and chorismate binding protein  42.78 
 
 		 425 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.453641  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1345  ComEC/Rec2 family protein  43.36 
 
 		 419 aa  294  2e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1594  ComEC/Rec2-related protein  38.46 
 
 		 421 aa  250  3e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.872637  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0374  ComEC/Rec2-related protein  34.01 
 
 		 420 aa  158  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  27.84 
 
 		 679 aa  59.7  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.09 
 
 		 797 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  31.69 
 
 		 694 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.48 
 
 		 780 aa  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.27 
 
 		 775 aa  47.4  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1656  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.91 
 
 		 781 aa  47  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.754434  hitchhiker  0.00232522 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13280  ComEC/Rec2-related protein  29.27 
 
 		 888 aa  46.6  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.368254 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.97 
 
 		 757 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.35 
 
 		 734 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0663  hypothetical protein  27.86 
 
 		 735 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.29 
 
 		 841 aa  45.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0680  hypothetical protein  27.86 
 
 		 735 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4338  ComEC/Rec2-related protein  24.46 
 
 		 798 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1594  ComEC/Rec2-related protein  22.7 
 
 		 511 aa  44.3  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25 
 
 		 808 aa  44.3  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2973  competence protein  21.51 
 
 		 626 aa  43.9  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.530414  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0243  ComEC/Rec2-related protein  22.01 
 
 		 369 aa  43.5  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2101  ComEC/Rec2-related protein  27.01 
 
 		 636 aa  43.9  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.639499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.25 
 
 		 798 aa  43.5  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1920  ComEC/Rec2-related protein  25 
 
 		 708 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112953  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2515  ComEC/Rec2-related protein  30.66 
 
 		 531 aa  43.1  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00025028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>