53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1345 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1345  ComEC/Rec2 family protein  100 
 
 
419 aa  813    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1216  conserved hypothetical protein, putative ComEC/Rec2-related protein domain protein  60.05 
 
 
418 aa  478  1e-134  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.387702  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0325  anthranilate synthase component I and chorismate binding protein  42.57 
 
 
425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.453641  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0421  ComEC/Rec2 family protein  43.36 
 
 
403 aa  298  9e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0761  ComEC/Rec2 family protein  39.8 
 
 
419 aa  264  3e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0064683  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1594  ComEC/Rec2-related protein  37.44 
 
 
421 aa  246  6e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.872637  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0374  ComEC/Rec2-related protein  38.37 
 
 
420 aa  171  1e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  32.35 
 
 
679 aa  62.4  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2538  ComEC/Rec2-related protein  28.8 
 
 
604 aa  60.1  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.18 
 
 
797 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  29.38 
 
 
694 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.58 
 
 
773 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.34 
 
 
773 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0450  hypothetical protein  28.12 
 
 
706 aa  53.1  0.000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.778093 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2124  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.62 
 
 
860 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.45 
 
 
773 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.14 
 
 
773 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.76 
 
 
773 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1425  ComEC/Rec2-related protein  29.36 
 
 
678 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.74 
 
 
752 aa  51.6  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.94 
 
 
794 aa  50.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.06 
 
 
780 aa  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.74 
 
 
773 aa  50.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.74 
 
 
772 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.74 
 
 
772 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.74 
 
 
654 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  26.74 
 
 
773 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1155  competence protein ComEC/Rec2, putative  28.77 
 
 
738 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.889631  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4131  ComEC/Rec2-related protein  25.5 
 
 
748 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1593  ComEC/Rec2-related protein  22.48 
 
 
734 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0152523 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1588  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  27.32 
 
 
760 aa  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4092  ComEC/Rec2-related protein  25.5 
 
 
748 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2515  ComEC/Rec2-related protein  33.86 
 
 
531 aa  47.8  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00025028  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1680  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.35 
 
 
726 aa  47.4  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00317004  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1645  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.35 
 
 
726 aa  47.4  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.550311  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.54 
 
 
818 aa  47  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1656  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.7 
 
 
781 aa  47  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.754434  hitchhiker  0.00232522 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.5 
 
 
761 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1432  hypothetical protein  23.65 
 
 
754 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0687894  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1920  ComEC/Rec2-related protein  28.5 
 
 
708 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112953  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3836  ComEC/Rec2-related protein  23.33 
 
 
769 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0604  putative competence locus E  30.65 
 
 
416 aa  44.7  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.790814  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0243  ComEC/Rec2-related protein  31.11 
 
 
369 aa  44.3  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.54 
 
 
796 aa  43.9  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3864  ComEC/Rec2-related protein  22.52 
 
 
816 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.97 
 
 
766 aa  43.1  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0617  hypothetical protein  25 
 
 
510 aa  43.1  0.008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.99 
 
 
896 aa  43.5  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.398529  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0899  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  39.02 
 
 
798 aa  43.1  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.383263  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1270  ComEC/Rec2-related protein  32.43 
 
 
439 aa  43.1  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23 
 
 
808 aa  43.1  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1716  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  36.67 
 
 
846 aa  43.1  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.116279  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.24 
 
 
757 aa  43.1  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>