52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0761 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0761  ComEC/Rec2 family protein  100 
 
 		 419 aa  825    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0064683  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0421  ComEC/Rec2 family protein  44.83 
 
 		 403 aa  313  4.999999999999999e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0325  anthranilate synthase component I and chorismate binding protein  37.91 
 
 		 425 aa  289  7e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.453641  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1216  conserved hypothetical protein, putative ComEC/Rec2-related protein domain protein  39.36 
 
 		 418 aa  270  2e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.387702  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1345  ComEC/Rec2 family protein  40 
 
 		 419 aa  245  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1594  ComEC/Rec2-related protein  33.74 
 
 		 421 aa  192  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.872637  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0374  ComEC/Rec2-related protein  33.42 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4338  ComEC/Rec2-related protein  28.02 
 
 		 798 aa  57  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  28.99 
 
 		 694 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1425  ComEC/Rec2-related protein  29.45 
 
 		 678 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.81 
 
 		 773 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.68 
 
 		 773 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  28.68 
 
 		 773 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.68 
 
 		 773 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0687  ComEC/Rec2-related protein  24.62 
 
 		 781 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.236524 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.68 
 
 		 772 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.68 
 
 		 654 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.81 
 
 		 773 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.68 
 
 		 772 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1996  putative competence protein  28.11 
 
 		 684 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.35 
 
 		 757 aa  50.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  27.94 
 
 		 679 aa  50.1  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.43 
 
 		 773 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.06 
 
 		 780 aa  49.7  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.71 
 
 		 795 aa  49.7  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3093  ComEC/Rec2-related protein  26.29 
 
 		 671 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662312  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.29 
 
 		 797 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  24.31 
 
 		 795 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0706  ComEC/Rec2-related protein  27.68 
 
 		 684 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.471107 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.66 
 
 		 773 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13280  ComEC/Rec2-related protein  28.8 
 
 		 888 aa  47.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.368254 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0330  putative hydrolase  27.13 
 
 		 474 aa  47.4  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0604  putative competence locus E  29.71 
 
 		 416 aa  47.4  0.0005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.790814  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1593  ComEC/Rec2-related protein  27.68 
 
 		 734 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0152523 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.78 
 
 		 837 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2229  ComEC/Rec2-related protein  16.13 
 
 		 502 aa  45.8  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.019727  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2458  ComEC/Rec2-related protein  24.86 
 
 		 724 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000361147  unclonable  0.000000000000145403 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2124  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.25 
 
 		 860 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118158  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  23.03 
 
 		 872 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2149  ComEC/Rec2-related protein  24.66 
 
 		 644 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.452162 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3836  ComEC/Rec2-related protein  27.17 
 
 		 769 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.02 
 
 		 778 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1680  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.67 
 
 		 726 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00317004  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1645  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.67 
 
 		 726 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.550311  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25 
 
 		 796 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1560  ComEC/Rec2-related protein  23.9 
 
 		 611 aa  44.3  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2040  hypothetical protein  27.61 
 
 		 763 aa  43.9  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2973  competence protein  25.5 
 
 		 626 aa  43.5  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.530414  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1397  ComEC/Rec2-related protein  23.33 
 
 		 702 aa  43.5  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027925 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0435  ComEC/Rec2-related protein  27.31 
 
 		 674 aa  43.1  0.008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.69 
 
 		 734 aa  43.5  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0899  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.13 
 
 		 798 aa  43.1  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.383263  normal  0.740662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>