More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1372 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1372  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
529 aa  1074    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 
559 aa  410  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
551 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01700  arginyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 
583 aa  404  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000411406  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0598  arginyl-tRNA synthetase  42 
 
 
553 aa  402  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 
556 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 
553 aa  389  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1944  arginyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 
575 aa  392  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.567724  normal  0.240014 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
556 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
556 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 
557 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
556 aa  385  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
556 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
556 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
556 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
556 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 
570 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
556 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 
553 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 
553 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 
556 aa  383  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 
556 aa  382  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1053  arginyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 
556 aa  382  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1081  arginyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 
556 aa  380  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 
556 aa  382  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  36.87 
 
 
559 aa  380  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 
551 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_002936  DET1270  arginyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 
556 aa  378  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0106385  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06570  arginyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 
575 aa  377  1e-103  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.645664 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
564 aa  375  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 
560 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 
589 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 
589 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 
554 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 
564 aa  373  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
561 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 
554 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 
554 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 
550 aa  372  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0109  arginyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 
562 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 
611 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 
564 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 
559 aa  371  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1019  arginyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 
563 aa  372  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.637999  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  37.48 
 
 
563 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 
586 aa  366  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 
556 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 
561 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0124  arginyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 
562 aa  368  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 
550 aa  365  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0405  arginyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 
542 aa  365  2e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 
586 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
551 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  34.2 
 
 
579 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  34.2 
 
 
579 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29980  arginyl-tRNA synthetase  37.36 
 
 
551 aa  362  8e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661681  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 
551 aa  362  1e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
546 aa  362  1e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 
584 aa  361  2e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 
562 aa  360  3e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0612  arginyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 
562 aa  359  7e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.954769  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 
546 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  38.39 
 
 
551 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
568 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0628  arginyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 
562 aa  355  1e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0559225  decreased coverage  0.00224273 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  34.94 
 
 
561 aa  355  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2036  arginyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 
561 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.432071  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  36.35 
 
 
561 aa  352  8e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 
598 aa  351  2e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 
592 aa  350  5e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 
564 aa  350  5e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 
586 aa  349  6e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 
592 aa  348  1e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1228  arginyl-tRNA synthetase  34.96 
 
 
550 aa  345  8.999999999999999e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0632  arginyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 
564 aa  345  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02918  arginyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
562 aa  344  2e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 
556 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1434  arginyl-tRNA synthetase  37.48 
 
 
569 aa  343  4e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0988806  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09800  arginyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 
559 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0453043  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4155  arginyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 
553 aa  339  8e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.60572  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2782  arginyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 
557 aa  338  9.999999999999999e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.535695  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  32.82 
 
 
585 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4035  arginyl-tRNA synthetase  36.77 
 
 
554 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.205832  hitchhiker  0.00704959 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1742  arginyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 
522 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  33.69 
 
 
587 aa  338  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2296  arginyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 
550 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.847928 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2114  arginyl-tRNA synthetase  34.42 
 
 
588 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3653  arginyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 
554 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3701  arginyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 
558 aa  336  5e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3866  arginyl-tRNA synthetase  33.56 
 
 
587 aa  336  5.999999999999999e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.42649  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1659  arginyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 
543 aa  335  7.999999999999999e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.826444  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4517  arginyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 
548 aa  334  2e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.753132  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 
575 aa  334  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5548  arginyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 
550 aa  334  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.0339829 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0903  arginyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 
580 aa  333  3e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1052  arginyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 
560 aa  333  4e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6158  arginyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 
550 aa  333  5e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0897  arginyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
532 aa  332  8e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000469666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1004  arginyl-tRNA synthetase  35.15 
 
 
570 aa  332  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4490  arginyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 
561 aa  332  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.703488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>