More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0897 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0897  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
532 aa  1107    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000469666 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
550 aa  405  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 
556 aa  402  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 
556 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 
556 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 
556 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 
556 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 
556 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 
559 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 
556 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 
556 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 
556 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 
556 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 
556 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 
557 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 
554 aa  395  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 
556 aa  398  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 
556 aa  395  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 
559 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 
554 aa  388  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 
554 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 
553 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 
553 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 
551 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
551 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 
553 aa  377  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 
589 aa  376  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 
589 aa  376  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 
546 aa  375  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0598  arginyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 
553 aa  376  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
563 aa  377  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 
561 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
551 aa  375  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 
551 aa  375  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 
550 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 
568 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 
551 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 
546 aa  369  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 
564 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 
561 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2036  arginyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
561 aa  365  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.432071  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0405  arginyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 
542 aa  366  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1081  arginyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 
556 aa  365  1e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 
592 aa  363  5.0000000000000005e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 
570 aa  362  6e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 
559 aa  362  9e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 
586 aa  361  1e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 
561 aa  360  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 
561 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29980  arginyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 
551 aa  360  4e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661681  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 
564 aa  360  4e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1053  arginyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
556 aa  359  8e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 
556 aa  359  9e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 
560 aa  358  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1270  arginyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 
556 aa  356  5.999999999999999e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0106385  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 
579 aa  356  5.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 
579 aa  356  5.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0612  arginyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
562 aa  356  6.999999999999999e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.954769  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 
561 aa  355  1e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
564 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 
564 aa  353  5e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 
586 aa  352  8.999999999999999e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4155  arginyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
553 aa  351  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.60572  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1654  arginyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 
549 aa  351  2e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0671403  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1434  arginyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 
569 aa  350  5e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0988806  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1004  arginyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 
570 aa  349  9e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4517  arginyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 
548 aa  347  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.753132  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0628  arginyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 
562 aa  348  2e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0559225  decreased coverage  0.00224273 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 
586 aa  347  3e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2296  arginyl-tRNA synthetase  36.35 
 
 
550 aa  347  3e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.847928 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2782  arginyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 
557 aa  345  1e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.535695  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 
592 aa  345  1e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 
562 aa  345  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0153  arginyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 
561 aa  345  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5548  arginyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 
550 aa  343  7e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.0339829 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 
584 aa  342  1e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1019  arginyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 
563 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.637999  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1495  arginyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 
543 aa  339  8e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4230  arginyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 
561 aa  338  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.228794 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18400  arginyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 
547 aa  337  1.9999999999999998e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.25654  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0188  arginyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 
594 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.826253  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0385  arginyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 
598 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603012  normal  0.077689 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 
587 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0096  arginyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 
602 aa  336  7e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11319  arginyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 
550 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1250  arginyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 
554 aa  335  1e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0409478  normal  0.0986355 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3866  arginyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 
587 aa  334  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.42649  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1742  arginyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 
522 aa  334  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2291  arginyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 
594 aa  333  6e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0084  arginyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 
594 aa  333  6e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72933  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0592  arginyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 
594 aa  333  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597736  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1997  arginyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 
594 aa  333  6e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02918  arginyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 
562 aa  333  6e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3099  arginyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 
594 aa  333  6e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0410  arginyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 
594 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0430  arginyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 
594 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4350  arginyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 
550 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301994 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0414  arginyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 
569 aa  333  7.000000000000001e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.872884  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0720  arginyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 
587 aa  332  8e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1372  arginyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
529 aa  332  8e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>