More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_18400 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_08000  arginyl-tRNA synthetase  63.55 
 
 		 556 aa  699    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00405045  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1250  arginyl-tRNA synthetase  59.03 
 
 		 554 aa  641    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0409478  normal  0.0986355 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18400  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 547 aa  1104    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.25654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2358  arginyl-tRNA synthetase  65.52 
 
 		 554 aa  741    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000260389 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2625  arginyl-tRNA synthetase  64.8 
 
 		 554 aa  733    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.657674  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0628  arginyl-tRNA synthetase  58.98 
 
 		 562 aa  640    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0559225  decreased coverage  0.00224273 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2467  arginyl-tRNA synthetase  58.83 
 
 		 566 aa  628  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0465289  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09800  arginyl-tRNA synthetase  56.35 
 
 		 559 aa  621  1e-176  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0453043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1052  arginyl-tRNA synthetase  57.5 
 
 		 560 aa  613  9.999999999999999e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1742  arginyl-tRNA synthetase  59.04 
 
 		 522 aa  613  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1197  arginyl-tRNA synthetase  56.47 
 
 		 556 aa  604  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4035  arginyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 		 554 aa  598  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.205832  hitchhiker  0.00704959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3653  arginyl-tRNA synthetase  55.23 
 
 		 554 aa  601  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1793  arginyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 		 558 aa  599  1e-170  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5548  arginyl-tRNA synthetase  55.62 
 
 		 550 aa  593  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.0339829 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4155  arginyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 		 553 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.60572  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1004  arginyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 		 570 aa  573  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29980  arginyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 		 551 aa  564  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661681  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2296  arginyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 550 aa  552  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.847928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4350  arginyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 		 550 aa  542  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301994 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11319  arginyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 550 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3898  arginyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 		 550 aa  535  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0879275  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3884  arginyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 		 550 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3972  arginyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 		 550 aa  535  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1228  arginyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 550 aa  530  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6158  arginyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 550 aa  530  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1899  arginyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 550 aa  521  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2092  arginyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 551 aa  520  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000567814  normal  0.0511831 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0195  arginine--tRNA ligase  46.58 
 
 		 598 aa  516  1.0000000000000001e-145  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1605  arginyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 620 aa  488  1e-136  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 559 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 557 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 556 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 553 aa  408  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 		 553 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 		 553 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 561 aa  403  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 		 564 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1944  arginyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 575 aa  395  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.567724  normal  0.240014 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 556 aa  398  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 561 aa  395  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01700  arginyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 583 aa  395  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000411406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 554 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 554 aa  395  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 556 aa  389  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 		 556 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 		 556 aa  389  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 556 aa  385  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 556 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 556 aa  389  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 556 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 		 556 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 556 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 556 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 556 aa  385  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 579 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 579 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 551 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 		 551 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 		 564 aa  385  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 586 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 561 aa  385  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 587 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 560 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 562 aa  382  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 561 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 568 aa  378  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0529  arginyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 		 614 aa  376  1e-103  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000661895 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 563 aa  378  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 570 aa  379  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_002936  DET1270  arginyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 556 aa  375  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0106385  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 		 586 aa  372  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 554 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1053  arginyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 		 556 aa  373  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 584 aa  373  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 551 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 561 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06570  arginyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 575 aa  371  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.645664 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 551 aa  370  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 564 aa  372  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 		 559 aa  369  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1081  arginyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 		 556 aa  372  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 559 aa  371  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 589 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 556 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2782  arginyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 557 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.535695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 585 aa  369  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02918  arginyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 562 aa  367  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 611 aa  368  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1482  arginyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 585 aa  365  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.747678  normal  0.431119 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1680  arginyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 585 aa  365  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0124  arginyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 		 562 aa  364  2e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1813  arginyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 585 aa  365  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 564 aa  363  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 589 aa  363  4e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0109  arginyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 		 562 aa  363  5.0000000000000005e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2675  arginyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 585 aa  360  5e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135814  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 551 aa  359  7e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1158  arginyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 585 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.381889  normal  0.900625 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 550 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>