48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5966 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5966  coenzyme PQQ synthesis D  100 
 
 		 92 aa  188  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.563471  normal  0.0171853 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5900  coenzyme PQQ synthesis D  93.55 
 
 		 93 aa  174  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.512535 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5161  coenzyme PQQ synthesis D  89.25 
 
 		 93 aa  170  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3248  coenzyme PQQ synthesis D  89.25 
 
 		 93 aa  170  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6167  coenzyme PQQ synthesis D  94.05 
 
 		 84 aa  164  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0242384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5120  coenzyme PQQ synthesis D  92.86 
 
 		 84 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.821568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0308  putative coenzyme PQQ synthesis protein D  85.37 
 
 		 93 aa  148  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0888365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7190  coenzyme PQQ synthesis D  75.58 
 
 		 93 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0181035  normal  0.442713 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6511  coenzyme PQQ synthesis D  63.75 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474205  normal  0.0408784 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2469  pyrroloquinoline quinone synthesis D  61.73 
 
 		 96 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.516173 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4037  coenzyme PQQ synthesis D  61.25 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0291  coenzyme PQQ synthesis D  55.42 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1701  coenzyme PQQ synthesis D  56.79 
 
 		 99 aa  98.6  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1781  coenzyme PQQ synthesis D  55 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654523  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2491  coenzyme PQQ synthesis D  52.44 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0887783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2097  coenzyme PQQ synthesis D  52.44 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.274384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2622  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  51.9 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2587  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein D  56.25 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0672438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3054  coenzyme PQQ synthesis D  50 
 
 		 97 aa  88.2  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0247  coenzyme PQQ synthesis D  54.43 
 
 		 98 aa  88.2  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00271715 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0858  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  53.75 
 
 		 90 aa  87.8  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0730  coenzyme PQQ synthesis D  50.6 
 
 		 105 aa  84  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240294  normal  0.0491643 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41650  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  50.62 
 
 		 92 aa  81.3  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2834  coenzyme PQQ synthesis D  46.34 
 
 		 95 aa  80.1  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.93819  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3306  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  48.15 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1448  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  45.45 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0178012  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1968  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  45.68 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00486118  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38790  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  48.15 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2250  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  46.25 
 
 		 88 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0811442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5160  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  46.25 
 
 		 91 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0402  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  46.25 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0377  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  46.25 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0406  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  46.25 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4826  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  46.25 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4673  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  44.58 
 
 		 94 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0510  coenzyme PQQ synthesis protein D  45.78 
 
 		 98 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3122  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  45.33 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0274282  normal  0.299906 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1681  coenzyme PQQ synthesis D  42.86 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.918941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  39.74 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2681  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  38.46 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3320  coenzyme PQQ synthesis D  45.76 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2176  coenzyme PQQ synthesis D  34.94 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2455  coenzyme PQQ synthesis D  34.57 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01589  bifunctional coenzyme PQQ synthesis protein C/D (Pyrroloquinolinequinone biosynthesis protein C/D)  43.08 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0882  coenzyme PQQ synthesis D  32.93 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1150  coenzyme PQQ synthesis D  31.25 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00942325 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0453  coenzyme PQQ synthesis D  34.15 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2032  coenzyme PQQ synthesis D  29.27 
 
 		 102 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>