51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4673 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4673  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  100 
 
 		 94 aa  197  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0510  coenzyme PQQ synthesis protein D  82.98 
 
 		 98 aa  167  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5160  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  72.09 
 
 		 91 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0406  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  68.6 
 
 		 91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0402  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  67.44 
 
 		 91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0377  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  67.44 
 
 		 91 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4826  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  67.44 
 
 		 91 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41650  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  53.66 
 
 		 92 aa  99.4  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1968  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  51.61 
 
 		 101 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00486118  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3306  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  50.6 
 
 		 92 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38790  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  50.6 
 
 		 92 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3122  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  46.75 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0274282  normal  0.299906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2681  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  48.05 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  46.75 
 
 		 90 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0291  coenzyme PQQ synthesis D  46.25 
 
 		 86 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6511  coenzyme PQQ synthesis D  46.91 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474205  normal  0.0408784 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2250  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  44.05 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0811442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3054  coenzyme PQQ synthesis D  46.25 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6167  coenzyme PQQ synthesis D  44.58 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0242384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2469  pyrroloquinoline quinone synthesis D  45.68 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.516173 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5900  coenzyme PQQ synthesis D  44.58 
 
 		 93 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.512535 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4037  coenzyme PQQ synthesis D  48.65 
 
 		 86 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325129  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0858  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  40.48 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2622  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  46.67 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7190  coenzyme PQQ synthesis D  44.44 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0181035  normal  0.442713 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5966  coenzyme PQQ synthesis D  44.58 
 
 		 92 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.563471  normal  0.0171853 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1701  coenzyme PQQ synthesis D  40.74 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5120  coenzyme PQQ synthesis D  44.58 
 
 		 84 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.821568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5161  coenzyme PQQ synthesis D  44.58 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0308  putative coenzyme PQQ synthesis protein D  42.86 
 
 		 93 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0888365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3248  coenzyme PQQ synthesis D  44.58 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0247  coenzyme PQQ synthesis D  42.5 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00271715 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1448  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  43.84 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0178012  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1781  coenzyme PQQ synthesis D  40 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654523  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2834  coenzyme PQQ synthesis D  40.74 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.93819  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2097  coenzyme PQQ synthesis D  38.75 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.274384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2491  coenzyme PQQ synthesis D  38.75 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0887783 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0730  coenzyme PQQ synthesis D  40 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240294  normal  0.0491643 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2587  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein D  37.5 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0672438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2455  coenzyme PQQ synthesis D  28.05 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2176  coenzyme PQQ synthesis D  32.93 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1681  coenzyme PQQ synthesis D  36.51 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.918941 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1800  coenzyme PQQ synthesis D  32.84 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0396916  normal  0.780369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5989  coenzyme PQQ synthesis D  36.84 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.894408  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5767  coenzyme PQQ synthesis D  34.48 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.986527  normal  0.838308 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01589  bifunctional coenzyme PQQ synthesis protein C/D (Pyrroloquinolinequinone biosynthesis protein C/D)  37.74 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1150  coenzyme PQQ synthesis D  25.84 
 
 		 102 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00942325 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1770  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  25.3 
 
 		 362 aa  41.2  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.836859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2154  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  28.12 
 
 		 372 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.113038 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2360  coenzyme PQQ synthesis D  28.26 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1818  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  28.57 
 
 		 366 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>