119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2512 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2512  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  348  3e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.309871  normal  0.46786 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0594  hypothetical protein  34.59 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0463064  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2181  hypothetical protein  35.15 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26664  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1206  hypothetical protein  32.94 
 
 		 175 aa  104  8e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0069  hypothetical protein  36.13 
 
 		 167 aa  97.4  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3411  hypothetical protein  34.18 
 
 		 165 aa  97.1  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3655  hypothetical protein  36.48 
 
 		 162 aa  96.7  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60530  hypothetical protein  40.31 
 
 		 162 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000012244  normal  0.488728 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5214  hypothetical protein  40.31 
 
 		 162 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000310717  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1788  hypothetical protein  34.5 
 
 		 174 aa  95.1  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.832383  normal  0.069652 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3725  hypothetical protein  34.59 
 
 		 164 aa  95.5  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3851  hypothetical protein  34.59 
 
 		 164 aa  95.5  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000116494 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3668  hypothetical protein  34.59 
 
 		 164 aa  95.5  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.118078 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0436  hypothetical protein  35.85 
 
 		 162 aa  95.1  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00784425  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0673  hypothetical protein  36.48 
 
 		 162 aa  94.7  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40830  hypothetical protein  38.28 
 
 		 164 aa  94.7  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3161  hypothetical protein  32.5 
 
 		 168 aa  92.8  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.604205  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0780  hypothetical protein  34.59 
 
 		 164 aa  92.4  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0646  hypothetical protein  35.22 
 
 		 162 aa  92  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3376  hypothetical protein  35.22 
 
 		 162 aa  92  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.879379  hitchhiker  0.00180507 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0644  hypothetical protein  35.22 
 
 		 162 aa  92  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.257597  hitchhiker  0.000000179995 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3997  hypothetical protein  35.22 
 
 		 162 aa  91.7  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4866  hypothetical protein  43.33 
 
 		 162 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1880  hypothetical protein  40.25 
 
 		 174 aa  91.3  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02877  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0695  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02827  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3181  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3471  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0692  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3288  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3431  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4314  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0431  hypothetical protein  32.3 
 
 		 168 aa  89  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1202  hypothetical protein  30.36 
 
 		 187 aa  89  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000824921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0497  hypothetical protein  34.52 
 
 		 166 aa  88.2  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4583  hypothetical protein  41.18 
 
 		 162 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206961  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4257  hypothetical protein  41.18 
 
 		 162 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2587  hypothetical protein  34.39 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4503  hypothetical protein  32.47 
 
 		 162 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.55256  normal  0.737083 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3407  hypothetical protein  32.48 
 
 		 164 aa  84.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3401  hypothetical protein  32.48 
 
 		 164 aa  84.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.572659 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3336  hypothetical protein  32.48 
 
 		 164 aa  84.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.568765 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3327  hypothetical protein  32.48 
 
 		 164 aa  84.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2386  hypothetical protein  29.63 
 
 		 164 aa  84.3  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3502  hypothetical protein  32.48 
 
 		 164 aa  84.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1808  hypothetical protein  31.48 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2515  hypothetical protein  33.73 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1525  hypothetical protein  28.99 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00081824  normal  0.11672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3606  hypothetical protein  32.12 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0512  hypothetical protein  31.06 
 
 		 168 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0682  hypothetical protein  31.82 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.244541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0713  hypothetical protein  31.82 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.028943 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0033  hypothetical protein  30.25 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0714  hypothetical protein  37.3 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3481  hypothetical protein  32.73 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3230  hypothetical protein  32.32 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1342  hypothetical protein  32.54 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00231374 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0016  hypothetical protein  30.52 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3282  hypothetical protein  31.52 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2543  hypothetical protein  31.01 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.603561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2816  hypothetical protein  29.52 
 
 		 176 aa  77.4  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.681975  normal  0.0187952 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3867  hypothetical protein  36.59 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2231  hypothetical protein  28.57 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.149904  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3084  hypothetical protein  33.06 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3326  hypothetical protein  33.06 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0230  hypothetical protein  32.53 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0345  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0682824 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3450  hypothetical protein  36.07 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.603459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2480  hypothetical protein  33.8 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0274158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2908  hypothetical protein  36.89 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00873066  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4125  hypothetical protein  31.52 
 
 		 196 aa  70.9  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2272  hypothetical protein  27.74 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00317915  normal  0.0200379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1628  hypothetical protein  34.38 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.511359  normal  0.669453 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0875  hypothetical protein  30.29 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.437041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2048  hypothetical protein  29.03 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0224363 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1923  hypothetical protein  35.54 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2137  hypothetical protein  35.54 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000987674  hitchhiker  0.00718349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6250  hypothetical protein  35.54 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.295569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2470  hypothetical protein  31.84 
 
 		 224 aa  67.8  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.433224  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2881  hypothetical protein  28.09 
 
 		 200 aa  67  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal  0.292612 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1940  hypothetical protein  27.1 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.713529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3669  hypothetical protein  32.23 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.229516  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0339  hypothetical protein  33.83 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.818951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2348  hypothetical protein  32.82 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.554101 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0494  hypothetical protein  32.85 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2232  hypothetical protein  27.74 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0365379  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2111  hypothetical protein  27.74 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1777  hypothetical protein  27.74 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0792  hypothetical protein  28.05 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0625  hypothetical protein  28.05 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.383977  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0528  hypothetical protein  28.05 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2057  hypothetical protein  28.05 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1083  hypothetical protein  27.74 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5522  hypothetical protein  27.74 
 
 		 207 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.365471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2019  hypothetical protein  28.05 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.120969  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0236  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0171455 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3135  hypothetical protein  26.92 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177362  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1796  hypothetical protein  28.05 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1937  hypothetical protein  28.05 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.806268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>