121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4583 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4583  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  326  6e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206961  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4257  hypothetical protein  99.38 
 
 		 162 aa  325  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60530  hypothetical protein  87.65 
 
 		 162 aa  287  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000012244  normal  0.488728 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5214  hypothetical protein  87.65 
 
 		 162 aa  287  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000310717  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4866  hypothetical protein  88.89 
 
 		 162 aa  275  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0714  hypothetical protein  88.89 
 
 		 162 aa  273  9e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260176  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0682  hypothetical protein  88.27 
 
 		 162 aa  272  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.244541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0713  hypothetical protein  88.27 
 
 		 162 aa  272  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.028943 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3411  hypothetical protein  82.61 
 
 		 165 aa  271  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4503  hypothetical protein  87.04 
 
 		 162 aa  270  7e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.55256  normal  0.737083 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1202  hypothetical protein  85.19 
 
 		 187 aa  265  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000824921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40830  hypothetical protein  78.4 
 
 		 164 aa  264  4e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02877  hypothetical protein  82.1 
 
 		 164 aa  261  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0695  conserved hypothetical protein  82.1 
 
 		 164 aa  261  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4314  hypothetical protein  82.1 
 
 		 164 aa  261  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3181  hypothetical protein  82.1 
 
 		 164 aa  261  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3471  hypothetical protein  82.1 
 
 		 164 aa  261  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0692  hypothetical protein  82.1 
 
 		 164 aa  261  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3288  hypothetical protein  82.1 
 
 		 164 aa  261  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3431  hypothetical protein  82.1 
 
 		 164 aa  261  3e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02827  hypothetical protein  82.1 
 
 		 164 aa  261  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2386  hypothetical protein  82.61 
 
 		 164 aa  259  8.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3407  hypothetical protein  80.86 
 
 		 164 aa  256  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3401  hypothetical protein  80.86 
 
 		 164 aa  256  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.572659 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3336  hypothetical protein  80.86 
 
 		 164 aa  256  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.568765 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3327  hypothetical protein  80.86 
 
 		 164 aa  256  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3161  hypothetical protein  75.31 
 
 		 168 aa  256  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.604205  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3502  hypothetical protein  80.25 
 
 		 164 aa  255  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3655  hypothetical protein  72.67 
 
 		 162 aa  246  7e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0436  hypothetical protein  72.67 
 
 		 162 aa  245  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00784425  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3230  hypothetical protein  79.63 
 
 		 177 aa  244  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0431  hypothetical protein  77.78 
 
 		 168 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0780  hypothetical protein  70.81 
 
 		 164 aa  240  6e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0512  hypothetical protein  77.16 
 
 		 168 aa  239  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3725  hypothetical protein  70.19 
 
 		 164 aa  238  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3851  hypothetical protein  70.19 
 
 		 164 aa  238  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000116494 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3668  hypothetical protein  70.19 
 
 		 164 aa  238  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.118078 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0016  hypothetical protein  70.19 
 
 		 162 aa  234  4e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0646  hypothetical protein  70.81 
 
 		 162 aa  226  9e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3376  hypothetical protein  70.81 
 
 		 162 aa  226  9e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.879379  hitchhiker  0.00180507 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0644  hypothetical protein  70.81 
 
 		 162 aa  226  9e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.257597  hitchhiker  0.000000179995 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3997  hypothetical protein  70.81 
 
 		 162 aa  226  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0673  hypothetical protein  70.81 
 
 		 162 aa  224  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2587  hypothetical protein  68.94 
 
 		 162 aa  222  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0033  hypothetical protein  57.14 
 
 		 164 aa  198  1.9999999999999998e-50  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1788  hypothetical protein  46.91 
 
 		 174 aa  154  4e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.832383  normal  0.069652 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3326  hypothetical protein  48.12 
 
 		 178 aa  153  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0069  hypothetical protein  47.17 
 
 		 167 aa  149  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1525  hypothetical protein  43.29 
 
 		 174 aa  149  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00081824  normal  0.11672 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3669  hypothetical protein  45.91 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.229516  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1880  hypothetical protein  45.68 
 
 		 174 aa  144  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2816  hypothetical protein  47.5 
 
 		 176 aa  143  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.681975  normal  0.0187952 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1628  hypothetical protein  42.77 
 
 		 179 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.511359  normal  0.669453 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3084  hypothetical protein  46.88 
 
 		 176 aa  140  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2543  hypothetical protein  39.49 
 
 		 179 aa  140  9e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.603561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2515  hypothetical protein  47.53 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1342  hypothetical protein  45.06 
 
 		 174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00231374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3282  hypothetical protein  44.38 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3606  hypothetical protein  44.38 
 
 		 167 aa  134  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1808  hypothetical protein  40.26 
 
 		 176 aa  134  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0497  hypothetical protein  42.33 
 
 		 166 aa  134  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3450  hypothetical protein  40.74 
 
 		 197 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.603459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2181  hypothetical protein  43.48 
 
 		 168 aa  133  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26664  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0594  hypothetical protein  40.88 
 
 		 180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0463064  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2272  hypothetical protein  38.22 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00317915  normal  0.0200379 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1940  hypothetical protein  36.25 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.713529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2231  hypothetical protein  37.5 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.149904  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3481  hypothetical protein  43.12 
 
 		 167 aa  128  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1414  hypothetical protein  36.88 
 
 		 203 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0531189  normal  0.0304198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3135  hypothetical protein  36.88 
 
 		 203 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177362  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2908  hypothetical protein  37.5 
 
 		 197 aa  127  9.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00873066  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1384  hypothetical protein  37.29 
 
 		 201 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2232  hypothetical protein  36.88 
 
 		 201 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0365379  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2111  hypothetical protein  36.88 
 
 		 201 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2480  hypothetical protein  38.99 
 
 		 196 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0274158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0230  hypothetical protein  42.41 
 
 		 184 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5522  hypothetical protein  36.88 
 
 		 207 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.365471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1083  hypothetical protein  36.88 
 
 		 194 aa  125  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0792  hypothetical protein  35 
 
 		 202 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0625  hypothetical protein  35 
 
 		 202 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.383977  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0528  hypothetical protein  35 
 
 		 202 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2057  hypothetical protein  35 
 
 		 202 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1937  hypothetical protein  35 
 
 		 234 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.806268  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2019  hypothetical protein  35 
 
 		 234 aa  124  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.120969  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1084  hypothetical protein  35 
 
 		 234 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452431  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5884  hypothetical protein  36.25 
 
 		 194 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2193  hypothetical protein  36.25 
 
 		 194 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2218  hypothetical protein  36.25 
 
 		 194 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3216  hypothetical protein  36.81 
 
 		 227 aa  124  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0618648  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2746  hypothetical protein  38.55 
 
 		 202 aa  124  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3064  hypothetical protein  37.71 
 
 		 197 aa  123  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1954  hypothetical protein  36.88 
 
 		 179 aa  123  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0709272  normal  0.160176 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1796  hypothetical protein  35 
 
 		 202 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0982  hypothetical protein  37.43 
 
 		 193 aa  122  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.524883  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2137  hypothetical protein  37.89 
 
 		 194 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000987674  hitchhiker  0.00718349 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1066  hypothetical protein  37.43 
 
 		 203 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2101  hypothetical protein  35.62 
 
 		 179 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.175881  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1847  hypothetical protein  38.31 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1844  hypothetical protein  38.31 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1498  hypothetical protein  36.99 
 
 		 203 aa  120  6e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672639 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>