More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4840 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4840  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
225 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal  0.251621 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4285  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  97.77 
 
 
225 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0276895  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6801  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  96 
 
 
225 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.793236  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1114  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.3 
 
 
229 aa  197  7.999999999999999e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384644  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0297  ABC basic amino acid transporter, inner membrane subunit  44.3 
 
 
244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0328  amino acid ABC transporter permease  43.86 
 
 
244 aa  181  6e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26230  histidine transport system permease protein  44.2 
 
 
229 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0832582  normal  0.643473 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.67 
 
 
246 aa  175  5e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5892  ABC transporter permease  43.3 
 
 
231 aa  174  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68080  ABC transporter permease  43.3 
 
 
231 aa  174  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382503  normal  0.0204508 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01551  ABC transporter permease protein  41.1 
 
 
246 aa  172  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2560  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.6 
 
 
230 aa  170  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.645171  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3448  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  41.55 
 
 
228 aa  169  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869706  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1589  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.64 
 
 
267 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4137  amino acid ABC transporter, permease protein  42.73 
 
 
237 aa  168  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2686  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  40.55 
 
 
228 aa  168  8e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02233  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  41.1 
 
 
228 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1348  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.1 
 
 
228 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.120013  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2857  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.94 
 
 
228 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.224945  normal  0.227891 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02193  hypothetical protein  41.1 
 
 
228 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3875  amino acid ABC transporter permease  42.29 
 
 
242 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0336  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.74 
 
 
234 aa  166  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2602  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  41.1 
 
 
228 aa  166  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.311053  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2464  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  41.1 
 
 
228 aa  166  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1344  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.1 
 
 
228 aa  166  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.917469  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2458  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  41.1 
 
 
228 aa  166  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2252  amino acid ABC transporter permease  41.63 
 
 
232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2789  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.56 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.113989  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2703  histidine ABC transporter permease HisQ  41.01 
 
 
228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2594  histidine ABC transporter permease HisQ  41.01 
 
 
228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2567  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.67 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.386415  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2494  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  41.01 
 
 
228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.174518  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2540  histidine ABC transporter permease protein HisQ  41.01 
 
 
228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.512507  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2582  histidine ABC transporter permease HisQ  41.01 
 
 
228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.114361 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003971  arginine/ornithine ABC transporter permease protein AotQ  38.98 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0592  arginine ABC transporter, permease protein  41.84 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0258675  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1593  arginine transport system permease protein  41.84 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.53 
 
 
228 aa  162  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.462378  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1539  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.44 
 
 
228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1429  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  40.44 
 
 
228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0521843  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0352  histidine transport system permease HisQ  40.44 
 
 
228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.179299  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4913  amino acid ABC transporter permease  45.81 
 
 
231 aa  161  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5359  amino acid ABC transporter, permease protein  45.37 
 
 
231 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1377  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.11 
 
 
229 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1959  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter, inner membrane component  39.83 
 
 
246 aa  160  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.450154  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4291  amino acid ABC transporter permease  38.99 
 
 
229 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4271  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.52 
 
 
231 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000112521 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3309  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.36 
 
 
234 aa  159  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825201  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0953  amino acid ABC transporter, permease protein  43.75 
 
 
240 aa  159  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0885  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.18 
 
 
229 aa  159  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.524811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3774  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.16 
 
 
229 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134573  hitchhiker  0.00153221 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3796  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.17 
 
 
229 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.719623  normal  0.0561262 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0987  histidine ABC transporter, permease protein  40.18 
 
 
229 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1474  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.89 
 
 
229 aa  158  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.996981  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3017  histidine ABC transporter, permease protein  40.18 
 
 
229 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.606762  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1580  histidine ABC transporter, permease protein  40.18 
 
 
229 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1247  histidine transport system permease protein  40.18 
 
 
229 aa  157  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1089  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  40.18 
 
 
229 aa  157  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1094  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  40.18 
 
 
229 aa  157  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.914927  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3990  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.16 
 
 
229 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3570  amino acid ABC transporter permease  37.61 
 
 
229 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.906452  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0889  amino acid ABC transporter, permease protein  39.73 
 
 
229 aa  156  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4485  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  37.16 
 
 
229 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1827  arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  37.61 
 
 
229 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.883387  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1430  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.16 
 
 
229 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0905208  normal  0.971438 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2927  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, innermembrane subunit  39.09 
 
 
233 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2065  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  41.07 
 
 
267 aa  155  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2290  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.78 
 
 
268 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142141  normal  0.98078 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4638  amino acid ABC transporter permease  39.17 
 
 
229 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3725  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.17 
 
 
229 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0898326 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4929  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.52 
 
 
231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0205937  hitchhiker  0.0000000789331 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2915  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.91 
 
 
229 aa  155  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5464  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.63 
 
 
229 aa  154  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2377  ABC His/Glu/Gln/Arg/opine transporter, inner membrane subunit  39.63 
 
 
243 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413222  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2236  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.96 
 
 
240 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1093  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.75 
 
 
229 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436853  normal  0.0653327 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2853  histidine transport system permease protein  39.81 
 
 
229 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2732  amino acid ABC transporter, permease protein  39.81 
 
 
229 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1410  histidine ABC transporter, permease protein  39.17 
 
 
229 aa  153  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157931  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1563  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.47 
 
 
237 aa  153  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.086799  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2791  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  39.81 
 
 
229 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249098  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2832  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  39.41 
 
 
246 aa  153  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3607  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.63 
 
 
229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488418  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.89 
 
 
268 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28022  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2322  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.74 
 
 
239 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.893058  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2809  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.2 
 
 
239 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309944  normal  0.926456 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2178  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.74 
 
 
239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.142027  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3594  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  41.74 
 
 
239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0310  amino acid ABC transporter permease  42.73 
 
 
231 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193986  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0299  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.62 
 
 
230 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0837568  normal  0.0626241 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0304  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.62 
 
 
230 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0016104  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0210  histidine ABC transporter, permease protein  39.63 
 
 
229 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1089  histidine ABC transporter, permease protein  39.63 
 
 
229 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.518061  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0483  histidine ABC transporter, permease protein  39.63 
 
 
229 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.158807  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1926  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.29 
 
 
228 aa  149  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4625  arginine/ornithine transport protein AotQ  41.58 
 
 
229 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1240  histidine ABC transporter, permease protein  39.63 
 
 
229 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.842706  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1791  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.73 
 
 
229 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.369418  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1453  amino acid ABC transporter, permease protein  40.25 
 
 
260 aa  149  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000402633  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1355  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  39.63 
 
 
229 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>